siRNA和shRNA的主要区别在于siRNA是一种短的dsRNA,其中2个核苷酸是激活RNA干扰(RNAi)的3'末端突出物,而shRNA包含一个加工成siRNA的环结构。此外,siRNA通过剂量效应是短暂的,最适合于某些医学疾病,而shRNA构建可以使用内源性处理机制进行优化,以获得高效力和低拷贝数的可持续效应。此外,siRNA的制备过程简单,而优化的shRNA产生较少的脱靶效应。
小干扰RNA(siRNA)和短发夹RNA(shRNA)是参与RNA干扰途径沉默途径的两类调控RNA,它们通过与靶mRNA的互补结合,以序列特**的方式导致靶mRNA的降解。
1.什么是siRNA–RNA干扰的定义、结构和作用2.什么是shRNA–RNA干扰的定义、结构和作用3.siRNA和shRNA之间的相似之处是什么–共同特征概述4.siRNA和shRNA之间的区别是什么–关键区别的比较
siRNA,shRNA,调控RNA,RNAi,序列特**降解,靶mRNA
小干扰RNA或siRNA是一种双链RNA分子,体积小;长度约为21到25个核苷酸。利用双链RNA的形成进行基因沉默是RNA干扰(RNAi)途径的关键途径之一。一般来说,rna干扰途径是负责击倒蛋白质作为基因表达的转录后调控。
Figure 1: SiRNA in RNAi Pathway
此外,长RNA双工体的裂解导致了siRNAs的形成。在这里,Dicer,一种dsRNA特**RNaseⅢ酶,与双链RNA形成复合物。这种酶将dsRNA裂解成siRNAs,在3'末端留下两个核苷酸的悬挑。之后,这些sirna与RISC(RNA诱导的沉默复合体)形成复合物,这是导致RNA双工中感链降解的主要原因。
短发夹RNA(shRNA)是一种相对较长的RNA分子,其区域形成发夹环。shRNA通常是在细胞内形成的人工分子,通过载体将相应的RNA基因导入细胞。实际上,它模拟了在细胞内自然形成RNA双链体的miRNA分子。
Figure 2: shRNA Formation
此外,shRNA的干区是通过与靶mRNA分子杂交形成的。在形成双链后,Dicer与复合物结合并将双链切割成siRNA分子。这些siRNA分子与RISC结合并以上述相同的方式降解感觉链。
siRNA是指由双链RNA的切割和加工产生的单链RNA分子,shRNA是指一个短小的RNA序列,它使一个紧密的发夹状的转折,可以用来沉默基因的表达。因此,这是siRNA和shRNA之间的主要区别。
siRNA代表小干扰RNA,shRNA代表短发夹RNA。
此外,siRNA与shRNA的一个重要区别是siRNA是在细胞内自然产生的,而shRNA是通过转化导入相应的RNA基因在细胞内人工产生的。
此外,siRNA是一种双链RNA分子,通常长度为21-25个核苷酸,而shRNA长度约为80对碱基,并包含内部杂交区域,从而形成发夹结构。因此,这也是siRNA和shRNA的区别。
另外,siRNA和shRNA的另一个区别是siRNA短而shRNA长。
此外,siRNA通过2个核苷酸的3'末端延伸形成dsRNA,激活RNA干扰(RNAi),而shRNA则包含一个加工成siRNA的环结构。
另外,siRNA和shRNA与miRNA的关系也存在差异。siRNA是由DICER或DROSHA蛋白内源性加工miRNA产生的,而shRNA则模仿miRNA。
siRNA通过剂量效应是暂时的,而shRNA则更具可持续性。
siRNA在高剂量时有效,shRNA在低剂量时有效。
效力是siRNA和shRNA的另一个区别。siRNA的效力较低,shRNA的效力较高。
siRNA的制备过程简单,而优化的shRNA可以减少嵌入miRNA支架的脱靶效应。
此外,siRNA可以通过直接作用于靶细胞来进行蛋白质的短期敲除,shRNA可以通过RNAi途径进行蛋白质的长期敲除。这是siRNA和shRNA的另一个区别。
siRNA或小干扰RNA是一类非编码的调控RNA,参与RNA干扰途径中靶mRNA的序列特**降解。它是一种短的RNA分子,与靶细胞形成RNA双链。同时,它也是由miRNA的内源性加工所导致的。相比之下,shRNA或短发夹RNA是一种模拟miRNA的人工RNA。它通过与miRNA降解相同的细胞机制降解为siRNA。一般来说,shRNA比siRNA长,并且包含一个发夹环。然而,siRNA和shRNA的主要区别在于它们在RNAi****降解靶mRNA的方法。
1. 奥基夫,艾琳P.“SiRNAs和ShRNAs:通过基因沉默进行蛋白质敲除的工具。” 材料与方法,2013年第3卷,doidoi:10.13070/mm.en.3.197.
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