关键区别：古细菌是单细胞有机体，缺乏细胞核，并释放甲烷作为新陈代谢的产物。细菌是单细胞有机体，缺乏细胞核、线粒体、叶绿体、球茎和内质网。

有机体对我们的生存很重要，因为人类和所有其他生物都是从有机体进化而来的。生物体可分为两类：真核生物和原核生物。原核生物微生物可进一步分为真核生物、细菌和古细菌三个领域。这可能会变得有点混乱，因为这两个在外观上是相似的，并且常常会因为外观本身而混淆，尽管它们在许多方面是不同的。

古菌是单细胞微生物的一个领域。古细菌最初被归类为原核生物的古细菌，但现在这种分类被认为是过时的。古菌是一种单细胞生物的三结构域系统中的一个合适的结构域，因为它们有着独立的历史，并且与其他微生物有许多不同。古菌进一步分为四个已知的门，但可能存在更多的门。“古细菌”一词源于古希腊语ἀρχαῖα、 意思是“古代的东西”。古细菌在其细胞内没有细胞核或任何其他膜结合的细胞器。1977年，卡尔·沃斯和乔治·E.首先将古菌划分为一个单独的类群。Fox基于核糖体RNA（rRNA）基因序列。它最初被称为古细菌和真细菌，后来更名为古细菌和细菌。Merriam Webster将“古菌”定义为“一个域（古菌）的微生物，尤其包括产甲烷的形式、一些红色的嗜盐形式和其他严酷的热酸性环境（如温泉）。”

古菌在形状和大小上与细菌相似；这就是混淆的根源，然而一些古细菌有非常不寻常的形状，例如Haloquadramum wal**yi生物有扁平和方形的细胞。古细菌也是已经发现的最古老的生物。它们的直径从0.1微米（μm）到15μm以上，呈各种形状，包括球形、棒状、螺旋状、片状、叶状细胞、针状细丝和矩形杆。虽然古细菌看起来与细菌相似，但它的基因和代谢途径与真核生物相似，包括有三种RNA聚合酶。古细菌依靠细胞膜中的乙醚脂质生存。古细菌的另一个独特特征是，它们能在极端条件下生存，如极热、极冷或极咸的水。此外，古菌细胞壁缺乏肽聚糖，这是目前在细菌。在大多数古细菌中，细胞壁是由表层蛋白质组装而成的，这些蛋白质形成一个刚性的蛋白质分子阵列，覆盖在细胞的外面，类似于链锁。古菌从糖、氨、金属离子、氢气、阳光和碳等多种来源获取能量，同时产生氮、甲烷、硫酸等副产品。古细菌通过二元分裂、分裂或萌芽等方式繁殖。古菌在地球的碳循环和氮循环中扮演着并继续扮演着巨大的角色。

细菌是原核微生物中最大的领域。它们被认为是最早出现在地球上的生命形式之一，存在于大多数栖息地，包括人类、动物和植物体内。据估计，地球上大约有5种诺利菌（5×10^30）。虽然最初细菌被认为是构成分裂菌纲的植物，但现在被归为原核生物。与真核生物的细胞不同，细菌细胞不含细胞核，很少有膜结合的细胞器。术语“bacteria”是新拉丁语“bacteria”的复数形式，来源于希腊语βακτρρρρν（baktērion）和βακτηρρρα（baktēria），意思是“棍，藤”，指当时发现的生物体的形状。“细菌”一词被用来指代所有的原核生物，不过后来随着更多的发现发现了这些生物之间的差异，这个词也随之改变。

细菌通常只有几微米长，有各种形状，包括球菌、杆菌、弧菌、螺旋体、螺旋体和立方形。细菌细胞的大小约为真核细胞的十分之一，长度通常为0.5–5.0微米。细菌的形状是由细胞壁和细胞骨架决定的，细胞壁和细胞骨架会发生改变和适应，以获得适当的营养，附着在表面，在液体中游动并逃离捕食者。细菌壁被一层脂膜包围，脂膜包裹并保存细胞内营养物质、蛋白质和细胞质的其他基本成分。作为原核生物，细菌没有膜结合的细胞器，因此很少有大的细胞内结构。它们缺乏真正的细胞核、线粒体、叶绿体和其他细胞器。它们也只有一种RNA聚合酶。细胞膜含有酯键，而细胞壁由肽聚糖构成。细菌通过二元分裂进行无性生长和繁殖。

细菌是地球的重要组成部分，在营养物质的循环利用中发挥着巨大的作用，例如从大气中固氮和腐烂。即使在极端条件下，细菌也通过转化溶解的化合物，如硫化氢和甲烷，提供维持生命所需的营养。细菌也可以通过在人体内产生各种疾病来危害身体，如呼吸系统疾病、艾滋病毒等。对于许多疾病，抗生素被用来清除对身体有害的细菌。细菌还有其他用途，如污水处理、分解漏油、生产奶酪和酸奶、回收金、钯、铜和其他金属。