分子对接和计分的关键区别在于,对接是一种用于确定两个分子之间结合亲和力的技术,而计分是通过计算分子间有利相互作用的数量来评估特定姿势的过程。
分子对接和计分这两个术语在分子模拟领域被使用。分子模拟是一种用来确定不同分子在给定物质中可能排列的技术。这项技术在创造新的稳定化合物方面很重要。
目录
1. 概述和主要区别
2. 什么是分子对接
3. 什么是分子计分
4. 并列比较-分子对接与表格评分
5. 摘要
什么是分子对接(molecular docking)?
分子对接是对一个候选配体与受体结合的计算模拟。这种方法预测了一个分子与另一个分子结合形成稳定络合物时的择优取向。这项技术的结果可以用来预测两个分子之间的结合强度或结合亲和力。在这里,分子计分功能也很重要。
一般来说,这项技术考虑到生物相关的分子,如蛋白质、肽、核酸、碳水化合物和脂类。这些分子非常重要,在我们体内的信号转导机制中起着重要作用。因此,这两个分子的方向,这两个将要结合的信号转导过程,影响了在此产生的信号类型。这意味着,分子对接在决定生物系统中信号传导过程中产生的信号强度和类型方面都很重要。
此外,分子对接技术在设计基于结构的药物时非常重要。这是因为它可以预测小分子如配体与合适的结合位点的构象。
什么是分子计分(molecular scoring)?
分子评分是评价分子对接过程的一种数学函数。在计算化学领域,评分函数用于预测两个分子对接后的结合亲和力。例如,如果我们有一个微粒药物的小分子,并且有一个生物靶点,例如蛋白质,我们可以评估药物对结合位点的亲和力。此外,分子计分可以用来预测两个蛋白质之间或一个蛋白质与DNA分子之间的分子间相互作用。
分子计分技术主要应用于药物设计过程,如虚拟筛选、从头设计、先导优化等。
分子对接(molecular docking)和得分(scoring)的区别
分子对接和评分在分子模拟中非常重要。分子对接和计分的关键区别在于,对接是一种用于确定两个分子之间结合亲和力的技术,而计分是通过计算分子间有利相互作用的数量来评估特定姿势的过程。
下面的信息图总结了分子对接和评分之间的区别。
总结 - 分子对接(molecular docking) vs. 得分(scoring)
分子对接和评分在分子模拟中具有重要意义。分子对接与评分的关键区别在于对接是一种用于确定两个分子之间结合亲和力的技术,而评分是通过计算有利分子间相互作用的数量来评估特定姿势的过程。
引用
1“对接(分子)。”对接(分子)–概述|科学直接主题,
2达尔,阿亚兹·马哈茂德。“分子对接:方法、类型、应用和基本挑战”,《经济学国际》,经济学国际,2017年3月27日,