虾青素最常见的副作用是无害的色素变化，如皮肤或大便出现轻微的橙色。即使是高剂量，也没有观察到对动物或人类的毒性作用。另外，不太常见的虾青素副作用会产生更大的影响，而低血压和激素水平变化等副作用会对健康产生严重影响。

虾青素是最常用的动物饲料添加剂，它为螃蟹、虾、龙虾和鲑鱼添加色素，使它们呈现出熟悉的红橙色。根据美国联邦法规，作为一种动物饲料添加剂，虾青素通常被认为是安全的，并且大多数人能够食用虾青素喂养的海鲜而不产生任何反应。1999年，美国。食品和药物管理局批准虾青素作为人类食用的食品成分。

作为一种膳食补充剂，虾青素最常用作抗氧化剂以降低胆固醇。倡导者还推荐虾青素改善眼睛健康，治疗腕管综合征、关节炎、肌肉损伤、胃肠道不适和男性不育。然而，应该注意的是，没有足够的证据支持这些说法，而且这种补充剂没有证明对健康有益。

常见的虾青素副作用包括色素沉着增加、毛发生长、激素水平变化和低血压。男性的钙水平降低、性欲下降和乳房增大也被观察到，但这些虾青素的副作用更为罕见。过敏反应也是可能的，可能相当危险。已知对虾青素过敏的人应避免食用虾青素和虾青素喂养的食物。

药物相互作用是另一个严重问题。例如，治疗血压的药物可能会被虾青素放大，导致血压降到危险的低水平。激素治疗和节育会受到补充剂对激素水平的影响。一些抗组胺药也观察到类似的交叉反应，哮喘药物可能对虾青素反应不好。负责从血液中清除多种药物的肝酶也会受到影响，导致这些药物在循环中的残留量增加。

其他补充剂和草药也可能引起反应。锯棕榈、黑升麻或其他影响激素的药物可能会产生不可预测的反应。虾青素的副作用，如低血压和钙水平降低，可被具有类似作用的物质放大。与虾青素一起使用其他类胡萝卜素抗氧化剂，如β-胡萝卜素和番茄红素，会减少吸收，不推荐使用。