苯并酶(benzonase)和DNA酶(dnase)的区别
核酸降解是许多分子生物学技术的重要组成部分。它被广泛应用于重组DNA技术中,以去除不需要的DNA和RN**段。核酸降解酶被称为核酸酶,根据需要的功能可以有不同的类型。降解DNA的核酸酶称为脱氧核糖核酸酶,而降解核糖核酸的核酸酶称为核糖核酸酶。这些酶主要用于体外实验,在体外分子试验中分离出纯DNA、RNA或蛋白质。苯并酶是一种同时降解DNA和RNA的核酸酶,而dnase只降解DNA。这是苯并酶和脱氧核糖核酸酶的关键区别。
目录
1. 概述和主要区别
2.什么是苯并酶
3. 什么是DNase
4. 苯并酶与DNase的相似性
5. 并列比较-苯并酶与DNA酶的表格形式
6. 摘要
什么是苯并酶(benzonase)?
苯并酶是一种来源于粘质沙雷氏菌的基因工程内切酶。这种酶是在大肠杆菌中工业化生产的。苯并酶能切割双链DNA、线形DNA、环状DNA和单链RNA。因此苯并酶具有重要的商业价值。苯并酶是一种蛋白质二聚体,有245个相同的氨基酸,约30kda的亚基和两个必需的二硫键。苯并酶在5'端裂解核酸,产生5'端游离的片段。苯并酶可以在任何序列上裂解核酸,但偏爱富含GC的区域。
苯并酶在-20℃下保存,酶活力的最适pH值为8.0~9.2。苯并酶的应用包括蛋白质二维凝胶电泳的样品制备,其中苯并酶去除结合核酸和从重组蛋白制剂中去除核酸污染物。它还用于降低蛋白质提取物的粘度,防止细胞在细胞混合物中**。
什么是DNA酶(dnase)?
脱氧核糖核酸酶(DNase)是一种核酸水解酶,只能切割双链DNA。DNase主要有两种类型:DNaseⅠ和DNaseⅡ。DNaseⅠ参与切割双链DNA,产生5'自由端的多核苷酸。DNaseⅡ参与切割双链DNA,产生具有3'自由端或悬垂的多核苷酸链。
DNA酶i
DNaseⅠ在7.0-8.0的最佳pH值下起作用。酶的活性依赖于许多离子辅助因子,包括Ca2+、Mg2+或Mn2+。Mg2+和Mn2+的活性决定了dna酶I的功能,在Mg2+存在下,DNase I独立地切割dsDNA的每条链。这是随机发生的。相反,在Mn2+存在的情况下,这种酶在几乎相同的位置切割两条DNA链。这种切割会产生两种类型的DN**段:一种是钝端,另一种是有一个或两个核苷酸悬置。
DNA酶ii
DNaseⅡ在最适pH为4.5-5.0时起作用,其活性需要二价金属离子,与DNaseⅠ相似。DNaseⅡ的作用机制主要包括三个步骤。
- Multiple single strand breaks are induced within the DNA backbone.
- Acid soluble nucleotides and oligonucleotides are produced.
- Non-linear hyperchromic shift occurs in the last phase.
DNase酶的主要抑制剂包括金属螯合剂、过渡金属和十二烷基硫酸钠、β-巯基乙醇等。
DNA酶的主要应用包括制备无DNA RNA和蛋白质提取物,以及在体外转录实验中去除模板DNA。
苯并酶(benzonase)和DNA酶(dnase)的共同点
- 两者都是水解酶。
- 两者都是核酸酶。
- 两者都是通过裂解核酸的磷酸二酯键来参与的。
- 两者都需要一个最佳的pH值和储存温度来维持酶的活性。
- 酶抑制剂包括螯合剂、过渡金属和洗涤剂化学品。
- 应用主要集中在获得高纯度的DNA、RNA和蛋白质提取物上。
- 这两种酶都可以通过基因工程产生。
苯并酶(benzonase)和DNA酶(dnase)的区别
苯并酶vs脱氧核糖核酸酶 | |
苯并酶是一种能够切割双链DNA、线形DNA、环状DNA和RNA的酶。 | DNase是一种能够切割双链DNA的酶。 |
酶的底物 | |
DNA和RNA都是苯并酶的底物。 | DNA是DNA酶的底物。 |
结构 | |
苯甲酸酶的最适pH范围为7.0~8.0 | DNaseⅠ的最适pH范围为7.0~8.0,DNaseⅡ的最适pH范围为4.5~5.0。 |
总结 - 苯并酶(benzonase) vs. DNA酶(dnase)
核酸酶广泛应用于分子生物学和基因工程的不同实验过程中。苯甲酸酶和脱氧核糖核酸酶有两种类型。苯并酶参与降解DNA和RNA,而DNase参与切割双链DNA。这就是苯并酶和脱氧核糖核酸酶的基本区别。目前,这两种核酸酶都是通过重组DNA技术生产的,这种技术可以产生更高质量的酶,并且可以最大限度地提高产量。
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引用
1.“来自牛胰腺的脱氧核糖核酸酶I D5025。”西格玛·奥尔德里奇,可在这里买到。访问日期:2017年9月19日。“脱氧核糖核酸酶II。”脱氧核糖核酸酶II–沃辛顿酶手册,可在这里获得。访问日期:2017年9月19日。
2《脱氧核糖核酸酶II》——沃辛顿酶手册,