\r\n\r\n
DNAプローブとRNAプローブの主な違いは、DNAプローブは標的塩基配列と相補的なDN**セグメントであり、RNAプローブは標的塩基配列と相補的な核酸配列である一本鎖RNAの延長であることである。
プローブとは、放射性または非放射性の分子で標識することができるDNAまたはRNAの合成短鎖のことである。長さは100〜1000塩基。プローブは、プローブ配列と相補的な標的核酸配列を検出するために使用されます。プローブが組み込まれると、相補的な配列または標的配列とハイブリダイズし、放射能を運ぶので標的配列を識別するために可視化される。プローブは、遺伝性疾患の検出、ウイルス学、法医学病理学、父子鑑定、DNA指紋法、RFLP、分子細胞遺伝学、in situハイブリダイゼーションなど、多くの微生物学および分子分野で重要な分子ツールである。
1. 概要と主な違い 2. DNAプローブとは 3. RNAプローブとは 4. DNAとRNAプローブの類似点 5. 横並び比較 - DNAプローブとRNAプローブの表形式 6. まとめ
DNAプローブは、一本鎖のDNAである。ハイブリダイゼーションにより、相補的な核酸配列(標的配列)の存在を検出するために使用することができる。DNAプローブが相補的な配列とハイブリダイズすると、2本鎖のハイブリッドが形成される。これらを検出するために、DNAプローブは通常、放射性同位元素、ビオチン、エピトープ、蛍光色素などで標識される。アルカリホスファターゼおよびアルカリホスファターゼは、ビオチン標識法およびビオチン標識法により標識することができる。
図01:DNAプローブ
DNAプローブの塩基配列は既知である。長さ100〜1000対の短い配列である。組換えDNA技術により、長いDNAプローブが作製できる。また、PCRやクローニングによっても作製することができる。臨床微生物検査室では、DNAプローブは感染症の迅速な診断に利用されています。
RNAプローブは、RNAの一本鎖の延長である。試料中の標的配列と相補的な配列である。これらは通常、ファージSP6、T7、T3のRNAポリメラーゼにより、in vitroのDNA転写によって合成される。線状化したプラスミドDNAからin vitro転写で長鎖RNAプローブを作製することができる。一般に、RNAプローブはDNAプローブに比べて相補的な配列に強く結合する。RNAプローブは、DNAプローブと同様に、転写時にラベル化することが可能です。
DNAプローブは、標的配列に相補的なDNAの短い断片です。一方、RNAプローブは、標的配列と相補的な短い一本鎖RNAである。したがって、この点がDNAプローブとRNAプローブの大きな違いである。また、DNAプローブにはA、T、C、Gが、RNAプローブにはA、U、C、Gが含まれています。
さらに、DNAとRNAのプローブのもう一つの違いは、熱力学的な安定性である。RNAプローブはDNAプローブに比べ、熱力学的安定性が高い。
以下のインフォグラフィックは、DNAプローブとRNAプローブの重要な違いを一覧にしたものです。
DNAプローブは短い一本鎖のDN**セグメントで、RNAプローブは短い一本鎖のRNA配列である。RNAプローブの熱力学的安定性はDNAプローブより高く、相補的な配列への結合はDNAプローブより強固である。そこで、本稿では、DNAプローブとRNAプローブの違いについてまとめてみた。
1 「RNAプローブ」RNAプローブ - 概要|Science Directトピックス.