保存配列と共有配列の重要な違いは、保存配列は同種または世代を超えて出現する類似の核酸またはアミノ酸配列であり、共有配列はDNAまたはRNAの保存性の高い領域で共通する核酸配列またはアミノ酸配列またはタンパク質であることである。

生物には似たような性質と異なる性質があります。生物のゲノムや遺伝子の構成は、生物間の関係や分類を研究する上で重要です。異なる生物に共通するヌクレオチド配列やアミノ酸配列がある。保守的な配列とは、生物種間で一貫性のある核酸やアミノ酸の配列のことです。そのため、系統樹を作成する際に系統学的に重要な役割を果たす。保存された配列の中には、より一般的に見られる特定の塩基配列がある。これらはコンコーダンス配列と呼ばれる。

カタログ

1. 概要と主な相違点 2. 保存配列とは 3. コンセンサス配列とは 4. 保存配列とコンセンサス配列の類似性 5. 並べて比較 - 表形式での保存配列とコンセンサス配列 6. まとめ

c***erved sequenceは何ですか？

保存配列とは、生物種間で類似している核酸配列やアミノ酸配列のことである。そのため、進化の過程では一貫しています。一般に、これらの配列は自然淘汰によって維持されている。これらは系統樹の中で変わらずに残っている。したがって、保存された配列は系統樹を構築する上で重要である。高度に保存された配列は、しばしば大きな機能的価値を持つ。また、遺伝性疾患の特定にも有用である。ただし、保存配列は、コード化された核酸配列でも非コード化された核酸配列でもよい。また、保存された配列は変異の速度が遅い。そのため、組成の変化がほとんどなく、世代を経ても変化が見られないこともある。

図01：コンサバティブシークエンス

リボソームの構成要素であるRNAは生命のあらゆる領域に存在し、真核生物の相同カセット配列やバクテリアのtmRNAなどは高度に保存された配列の一例である。バイオインフォマティクスの手法、特に配列マッチングツールを用いると、保存配列の同定が非常に容易になる。また、複数配列のアライメントにより、保存された配列の可視化が容易になります。

c***ensus sequenceは何ですか？

共有配列とは、DNAやRNAの保存された領域に共通して見られる配列のことである。非常に特殊な塩基配列である。例えば、大腸菌のプロモーターの-10にはTATAAT（Pribnow box）という一貫した配列があり、これは高度に保存された配列である。同様に、大腸菌のプロモーターにも-35にTTGACAという一貫した配列がある。一貫性のある配列は「ボックス」とも呼ばれる。

図02：コンセンサス配列

DNAやRNAの他に、タンパク質も同じアミノ酸の配列を持っています。タンパク質結合部位は、通常、一貫した配列で表される。制限酵素もまた、一貫した配列を持っている。また、スプライスサイトも一致した配列である。保存配列と同様に、コンセンサス配列もバイオインフォマティクスツールで計算し、可視化することができる。

控えめとc***sensus sequenceの共通点

• 保守的で一貫性のある配列とは、核酸やアミノ酸の配列で、種間で共通する配列のことである。
• 保存配列も一致配列も、バイオインフォマティクスツールで可視化することができる。
• 分子生物学の分野で広く使われている。

控えめとc***sensus sequenceの違い

保存配列とは、生物種間で一致する核酸やアミノ酸の配列であり、コンセンサス配列とは、特定の保存領域内で非常に特異的で共通する塩基やアミノ酸の配列のことである。つまり、これが保存配列と整合配列の重要な違いなのです。また、保存配列とコンセンサス配列のもう一つの違いは、保存配列は系統学的に重要であるのに対し、コンセンサス配列は通常、タンパク質結合部位、スプライス部位、制限酵素切断部位などであることである。

概要 - 控えめ vs. c***sensus sequence

保存配列とは、生物種間で類似している核酸やタンパク質の配列のことです。ヒストンプロモーター、リボソーム結合部位、複製部位、アミノ酸配列などが保存配列の例として挙げられる。一方、共有配列とは、ある保存配列の中でより一般的な特定の塩基やアミノ酸のことである。大腸菌プロモーターの-10 box、-35 box、タンパク質結合部位、スプライス部位、制限酵素認識部位などが共通配列の例として挙げられます。そこで、保存配列とコンセンサス配列の違いについてまとめてみました。

引用

1 "保守的な配列". english wikipedia.Org 2020.