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塩基配列とアミノ酸配列の大きな違いは、塩基配列がDNAやRNA分子のヌクレオチドの配列であるのに対し、アミノ酸配列はペプチドやタンパク質のアミノ酸がつながった文字列であることです。
DNAとRNAは生物が持つ主要な核酸で、DNAは生物の遺伝情報を格納しています。そのため、ほとんどの生物はDNAからなるゲノムをもっています。染色体上の遺伝子または特定のヌクレオチド断片は、タンパク質をコードしています。遺伝暗号は、遺伝子のヌクレオチド配列に隠されている。遺伝子発現の過程で、塩基配列が転写され、タンパク質のアミノ酸配列に翻訳される。
1. 概要と主な違い 2. 塩基配列とは 3. アミノ酸配列とは 4. 塩基配列とアミノ酸配列の類似性 5. 横並び比較-塩基配列とアミノ酸配列の表形式 6. 総括
ヌクレオチドは、DNAやRNAの構成要素である。各ヌクレオチドは、窒素塩基、五炭糖、リン酸基を持つ。塩基は、4つのヌクレオチドの間で異なる成分である。そのため、ヌクレオチドは塩基によって名前がつけられている。つまり、核酸の塩基配列は、その核酸の塩基配列を表している。
図01:ベースシーケンス
一般的に塩基配列は、細胞の遺伝情報を担っている。ヌクレオチド配列は、アデニン(A)、チミン(T)、グアニン(G)、シトシン(C)など、ヌクレオチドの塩基の最初の文字で書くことができます。RNA配列では、ヌクレオチド配列はアデニン(A)、ウラシル(U)、グアニン(G)、シトシン(C)である
アミノ酸配列とは、ペプチドやタンパク質を構成するアミノ酸の文字列のことです。このように、アミノ酸はタンパク質の構成要素である。mRNA配列は遺伝子の転写によって生成され、コード配列中のヌクレオチドの順序によって最終的なタンパク質が決定される。この3つのヌクレオチドが合わさってコドンを形成し、アミノ酸が決定されるのです。このように、3つのDNA塩基のグループは、それぞれ特定のアミノ酸を表すコードとなっている。例えば、DNAの塩基配列CTGは、アミノ酸のロイシンをコードしています。ここでも、20個のアミノ酸を決定するコドンは64個用意されている。最終的には、ユニークなアミノ酸の配列によって、特定のタンパク質が作られる。
図02: アミノ酸配列
アミノ酸の配列は、タンパク質の構造と立体的な形状を決定する重要な要素である。タンパク質におけるアミノ酸の役割を決めるのは、それぞれのアミノ酸が持つ固有の性質である。
塩基配列はDNAやRNAのヌクレオチドの文字列、アミノ酸配列はタンパク質のアミノ酸の文字列である。これが塩基配列とアミノ酸配列の決定的な違いなんですね。さらに、塩基配列には4種類のヌクレオチドがあるのに対して、アミノ酸配列には20種類のアミノ酸がある。
また、塩基配列とアミノ酸配列のもう一つの違いは、塩基配列は2本鎖で存在できるのに対し、アミノ酸配列は2本鎖で存在できないことである。
以下のインフォグラフィックは、塩基配列とアミノ酸配列の違いをより詳しく示したものである。
塩基配列とアミノ酸配列は、アミノ酸の塩基配列コードで、3つの塩基からなる関連する配列である。したがって、塩基配列は、アミノ酸配列の遺伝暗号を含む配列である。実質的には、塩基配列はDNAやRNAの単量体配列であり、アミノ酸配列はタンパク質の単量体配列である。そこで、本稿では、塩基配列とアミノ酸配列の違いについてまとめる。
1 アミノ酸とは、ある一点からコード化された3つの塩基のグループ〉、『生化学』。Fifth Edition, US National Library of Medicine, 1 January 1970, available here."核酸配列", ウィキペディア, ウィキメディア財団, 2019年3月6日, ここで入手可能.2 "核酸配列", ウィキペディア, ウィキメディア財団, 2019年3月6日