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co**idとphage midの決定的な違いは、含まれている配列の種類です。co**idはcosサイトとプラスミドを含んでいます。したがって、ファージボディがF1ファージの複製元を含むプラスミドであるのに対し、ハイブリッドベクターである。
コ○助やファージミドは、クローニングの目的、特に大きなDN○○セグメントのクローニングに使用されます。コ○助とファージミドは、それぞれプラスミドとして複製されるか、ウイルス粒子としてパッケージングされ、複製されるかのいずれかである。
1. 概要と主な違い 2. Co**idとは 3. ファージとは 4. Co**idとファージの類似点 5. 横並び比較 - Co**idとファージMIDの表形式 6. 総まとめ
Co**idは、cosサイトとλファージ粒子から抽出したプラスミドからなるハイブリッドプラスミドです。このcos部位は、200塩基対の長いDNA断片である。そのため、プラスミドがウイルスのDNAと一致するように、粘着性または粘着性の末端を持っている。したがって、cos部位は、DNAのパッケージングに不可欠である。
コスサイトは3つあります。
図01:コ○イド
また、コ○助は適切な複製源を用いて一本鎖DNAや二本鎖DNAを複製することができる。コ○助は形質転換体を選択するためのマーカーとして、抗生物質耐性遺伝子を持つことが多い。したがって、コ○助をベクターとして使用することでクローニングが容易になり、ベクターを制限酵素で消化することでこれらの断片を抽出することができるのである。
ファージは、ファ○イドとも呼ばれ、ハイブリッドベクターである。ファージは、真ん中にf1複製起点と呼ばれる特定の複製起点を持つ。ファージオリジンからのf1複製抽出物。
ファージは一本鎖および二本鎖のDNAを複製することができ、プラスミドとして単独で複製するか、ファージ粒子にパッケージされて最終的に細菌の宿主である大腸菌に感染することが可能です。大腸菌に感染する際、f1ファージはバクテリアの毛の存在を必要とします。このように、性毛はファージのin vitroパッケージングに重要な役割を担っています。
コ○助 vs ファージ | |
Co**idは、cosサイトとプラスミドを含むハイブリッドベクターです。 | ファージペプチドは、F1ファージの複製元を含むプラスミドである。 |
Cosサイトの存在 | |
Cos部位はco**idに存在し、in vitroでのパッケージングに必要です。 | Cos遺伝子座はファージに存在しない。 |
F1複製起点の存在 | |
co**idでは、fi複製元が存在する場合と存在しない場合があります。 | 複製されたF1はファージに由来する。 |
抗生物質耐性遺伝子の有無 | |
抗菌剤耐性遺伝子はコ○助の中に存在し、形質転換体と非形質転換体の識別に利用されている。 | ファージに抗生物質耐性遺伝子がないこと。 |
In vitro パッケージング要件 | |
コスサイトが必要です。 | セクシャルヘアーは必須です。 |
コ○イドやファージは、組換えDNA技術に用いられるクローニングベクターです。コ○イドは、cosサイトと呼ばれる特殊な粘着性の末端を持つハイブリッドベクターです。これらのcos部位は、in vitroパッケージングに必要なものである。一方、ファージミドはf1ファージ由来の複製元f1を含むプラスミドである。co**idとファージペプチドはどちらも独立して複製することができ、細菌細胞にin vitroでパッケージングすることができる。これらは、コ○助とファージミッドの重要な違いである。
1. Qi, H et al."Phage intermediate vectors for phage display: properties, characteristics and structure", Journal of Molecular Biology, US National Library of Medicine, 30 March 2012.Collins, J and B Hohn. "Co**ids: a plasmid gene cloning vector that can be packaged in vitro in the phage λ-head", Proceedings of the National Academy of Sciences, National Library of Medicine, September 1978.こちらで入手可能です 2. Collins, J and B Horn."Co**ids: a plasmid gene cloning vector that can be packaged in vitro in the head of phage Lambda", Proceedings of the National Academy of Sciences, National Library of Medicine, September 1978.