主な違い - Vntr vs Str

DNAの研究は、系統関係の理解と決定、遺伝病の診断、生物のゲノムのマッピングに大いに役立っている。DNA分析に関連する多くの技術は、未知のDNAプールから特定の遺伝子やDNA配列を同定するために使用されます。これらは遺伝マーカーと呼ばれるものです。遺伝マーカーは、分子生物学において、個体間や種間の遺伝的変異を同定するために用いられる。個人間で多型を示す遺伝子マーカーには、VNTR（Variable Number Tandem Repeat）とSTR（Short Tandem Repeat）があります。いずれも非コード型反復配列DNAで、タンデムリピート配列である。VNTRは、短いヌクレオチド配列が数回繰り返されるゲノムの一部です。STRは、2〜13個のヌクレオチドからなる繰り返し単位が100回ごとに組織化されているゲノムの別のDNA部分です。VNTRとSTRの重要な違いは、繰り返し配列中のヌクレオチドの数です。VNTRとSTRは、法医学研究において幅広い応用が可能です。

カタログ

1. 概要と主な相違点 2. VNTRとは 3. STRとは 4. VNTRとSTRの類似点 5. 並べて比較 - 表形式でのVNTRとSTR 6. まとめ

株式会社ビー・エヌ・ティー・エヌ（vntr）は何ですか？

タンデムリピートは、染色体の特定の位置で、頭から尻尾まで繰り返し現れる短い配列である。タンデムリピートは、他の配列やヌクレオチドを含まない。vntrはこのタンデムリピートの一つで、繰り返し単位が10〜100塩基からなる小さな衛星である。このタンデムリピートは、多くの染色体に存在する。これらは、主に染色体のサブクロモゾーム領域に、ヒトゲノム全体に分布しています。

VNTRは個人間でタンデムリピート多型が見られる。染色体上の特定の位置にあるVNTRの長さは、DN**セグメントで編成される繰り返し単位の数にばらつきがあるため、個体間で大きく変動します。したがって、VNTRは個体識別のための強力なツールとして使用でき、VNTR解析は遺伝学、生物学研究、法医学およびDNA指紋法において広く用いられています。VNTRは骨髄移植の移植量を定量するために用いられる最初の遺伝子マーカーであり、法医学においてDNA解析に用いられる最初の多型マーカーでもありました。

図01：6つの個体におけるVNTRのばらつき

VNTR解析は、制限酵素断片長多型とsouthern hybridisationによって行われます。そのため、比較的大きなDNAサンプルを必要とする。また、VNTRプロファイルの解釈にも問題がある。これらの制約から、法医学遺伝学におけるVNTRの使用は限定的であり、STR分析に取って代わられている。

構造体(str)は何ですか？

STRはVNTRに類似しており、2〜13個のヌクレオチド反復単位が連なった高度に反復的なDN**セグメントである。ただし、VNTRとは繰り返し配列の塩基数、繰り返し回数が異なる。STRはマイクロサテライトである。

STR解析は、繰り返し単位の正確な数を測定するために用いられる。 strは個人間で大きく変動し**、vntと似ている。 STRの遺伝子型は個人によって異なる。そのため、STR解析は分子生物学において、2つ以上のサンプルのDNA上の特定の遺伝子座を比較するために使用されます。そのため、STRは分子生物学において強力な遺伝的マーカーとみなされている。多型性が高く、長さが比較的短いため、個体識別のための優れたツールになります。

STRは現在、法医学遺伝学における多型解析に最もよく使われているツールである。法医学分野では、STR多型の解析が行われることが多い。STRモチーフはゲノム中に分布している。str解析には、VNTR解析のような制限酵素によるDNAの切断は必要ありません。strの長さは、PCR技術を使って、目的の領域を特定の**プローブでDNAにライゲーションすることによって決定します。

図02：サンプル間のSTRのばらつき

株式会社ビー・エヌ・ティー・エヌ（vntr）と構造体 (str)の共通点

• VNTRとSTRは非コード化されたDNAです。
• 両者は連動して繰り返される。
• 両遺伝子ともDN**セグメント長の違いにより、個体間で多型を示す。
• どちらもDNA指紋や法医学の研究において強力な遺伝子マーカーとして利用されている。

株式会社ビー・エヌ・ティー・エヌ（vntr）と構造体 (str)の違い

概要 - 株式会社ビー・エヌ・ティー・エヌ（vntr） vs. 構造体 (str)

VNTRとSTRは、分子生物学、特に法医学において強力な遺伝子マーカーである。ただし、繰り返し配列のヌクレオチドの数と長さは異なり、VNTRは10～100ヌクレオチドの繰り返し、STRは2～13ヌクレオチドの繰り返しである。これがVNTRとSTRの違いである。

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引用

1 "Forensic Genetics Science", CRG - Committee on Responsible Genetics, n, p., n.d. Web.こちらからご覧いただけます 2017年7月2日"STR分析"、ウィキペディアウィキメディア財団、2017年3月22日。メッシュです。こちらからご覧いただけます 2017.7.10 2 「STR解析」『ウィキペディア』。ウィキメディア財団、2017年3月22日。取得しました。