ベンゾナーゼとディーエヌエー酵素の違い

核酸分解は、多くの分子生物学的手法において重要な要素である。組換えDNA技術において、不要なDNAやRN**セグメントを除去するために広く使用されています。核酸分解酵素はヌクレアーゼと呼ばれ、必要とされる機能に応じて様々な種類がある。DNAを分解するヌクレアーゼをデオキシリボヌクレアーゼ、RNAを分解するヌクレアーゼをリボヌクレアーゼと呼びます。これらの酵素は、主に体外分子実験において、純粋なDNA、RNAまたはタンパク質を単離するために使用されます。ベンゾナーゼはDNAとRNAの両方を分解するヌクレアーゼであるのに対し、デオキシリボヌクレアーゼはDNAのみを分解する。これがベンゾナーゼとデオキシリボヌクレアーゼの重要な違いである。

カタログ

1. 概要と主な違い 2. ベンゾナーゼとは 3. DNaseとは 4. ベンゾナーゼとDNaseの類似点 5. 横並び比較 - ベンゾナーゼとDNAaseの表形式 6. まとめ

ベンゾナーゼは何ですか？

ベンゾナーゼは、Serratia marcescens由来の遺伝子組み換えエンドヌクレアーゼです。この酵素は、大腸菌で工業的に生産されています。ベンゾナーゼは、二本鎖DNA、線状DNA、円形DNAおよび一本鎖RNAを切断する能力があるため、商業的に重要である。ベンゾナーゼは245個の同一アミノ酸からなるタンパク質二量体で、約30kdaのサブユニットと2個の必須ジスルフィド結合を持つ。ベンゾナーゼは核酸を5'末端で切断し、5'末端の遊離断片を生成する。ベンザーゼはどのような配列の核酸でも切断できるが、GCに富んだ領域を好む。

Benzonaseは-20℃で保存され、酵素活性の至適pHは8.0から9.2です。Benzonaseの用途としては、タンパク質二次元ゲル電気泳動用の試料調製で、Benzonaseが結合した核酸を除去し、組み換えタンパク質調製から核酸汚染物を除去することが挙げられます。また、タンパク質抽出液の粘度を下げたり、細胞混合物中の細胞**を防ぐために使用されます。

DNA酵素(dnase)は何ですか？

デオキシリボヌクレアーゼ（DNase）は、二本鎖DNAのみを切断する核酸加水分解酵素で、主にDNase IとDNase IIの2種類があります。 DNase Iは二本鎖DNAの切断に関与し、5フィート自由端のあるポリヌクレオチドを生成し、DNase IIは二本鎖DNAを切断して3フィート自由端またはオーバーハングを有するポリヌクレオチド鎖の生産に関与しています。

DNAase i

DNase Iの至適pHは7.0-8.0です。酵素活性は、Ca2+、Mg2+、Mn2+などのイオン性補酵素に依存し、Mg2+とMn2+の活性がdnaase Iの機能を決定する。 Mg2+存在下では、DNase IはdsDNAの各鎖を独立に切断する。これはランダムに発生します。一方、Mn2+の存在下では、この酵素は両方のDNA鎖をほぼ同じ位置で切断する。この切断により、鈍い末端を持つDN**セグメントと、1つまたは2つのヌクレオチドのオーバーハングを持つDN**セグメントの2種類のセグメントが生成される。

図02：DNase

DNAase ii

DNase IIは最適pH4.5-5.0で作用し、その活性にはDNase Iと同様に2価の金属イオンが必要である。DNase IIの作用機構は主に3つのステップから構成される。

1. DNAの骨格内に複数の一本鎖切断が誘導される。
2. 酸可溶性ヌクレオチド、オリゴヌクレオチドを製造しています。
3. 最終局面では非線形のハイパークロミックシフトが発生する。

DNase酵素の主な阻害剤としては、金属キレート剤、遷移金属、ドデシル硫酸ナトリウムやβ-メルカプトエタノールなどがあります。

DNA酵素の主な用途としては、DNAを含まないRNAやタンパク質の抽出物の調製、試験管内転写実験における鋳型DNAの除去などが挙げられる。

ベンゾナーゼとディーエヌエー酵素の共通点

• どちらも加水分解酵素である。
• どちらもヌクレアーゼである。
• いずれも核酸のホスホジエステル結合を切断することで関与する。
• どちらも酵素活性を維持するために最適なpHと保存温度を必要とします。
• 酵素阻害剤には、キレート剤、遷移金属、洗浄剤などがある。
• アプリケーションは、高純度のDNA、RNA、タンパク質抽出物を得ることに重点を置いています。
• これらの酵素は、いずれも遺伝子操作によって生産することができる。

ベンゾナーゼとディーエヌエー酵素の違い

概要 - ベンゾナーゼ vs. ディーエヌエー酵素

リボヌクレアーゼは、分子生物学や遺伝子工学の様々な実験プロセスで広く利用されています。ベンゾナーゼとデオキシリボヌクレアーゼの2種類がある。ベンゾアーゼがDNAやRNAの分解に関与するのに対し、DNaseは二本鎖DNAの切断に関与する。これがベンゾアーゼとデオキシリボヌクレアーゼの基本的な違いである。現在、この2種類のリボザイムは、より高品質の酵素を生産し、収量を最大化するために、組換えDNA技術によって生産されています。

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引用

1. "Deoxyribonuclease I D5025 from bovine pancreas." -Sigma Aldrich, こちらから入手可能です。2017年9月19日にアクセスしました。デオキシリボヌクレアーゼII」 「デオキシリボヌクレアーゼII - Worthington Enzyme Handbook」はこちらでご覧いただけます。Accessed September 19, 2017.2 "Deoxyribonuclease II."-Worthington Enzyme Handbook,.