主要區別
原生菌和真菌的主要區別在於，原生生物是具有單細胞組織的有機體，而真菌是具有多細胞組織的有機體。
原始派(protists) vs. 真菌(fungi)
原生生物是具有單細胞組織的有機體，而真菌是具有多細胞組織的有機體。原生生物非常小，只能在顯微鏡下看到，而真菌大到可以用肉眼觀察到，有些也是小物種。一些原生生物的細胞壁由植物和真菌組成，而真菌的細胞壁則含有幾丁質。
有些原生生物沒有細胞壁，而所有真菌都有細胞壁。原生質體與真菌有不同的細胞間組織。原生質是卵母細胞，而真菌是隔細胞和卵母細胞。原核細胞有細胞質，不包含隔室，而真菌有細胞質，可能包含或不包含隔室。
原生生物大多是可移動的，而真菌是不可移動的。原生生物在某些物種中含有纖毛和鞭毛；另一方面，真菌不包含這種結構。在原生生物中，線粒體的基因組數量保持不變，而在真菌中，線粒體基因組的數量則不保持保守。原生生物具有高度發達的滲透調節，而真菌的滲透調節不發達。
在原生生物中，營養獲得的過程是混合營養的，而在真菌中，營養獲得的過程是腐生的。在原生生物中，線粒體總是有基因組儲存，而在真菌中，線粒體總是有基因組減少。原生生物的細胞膜通常是可變的，而真菌的細胞膜通常是幾丁質的。
比較圖
什麼是原生生物(protists)？
原生生物是具有單細胞組織的有機體，其細胞被稱為原核細胞。一些原生生物有一個細胞壁，但這種結構並非全部存在。在原生生物中，它的結構也是可變的。它沒有類似細胞質間隔的細胞間組織。
它也有一些外部結構，如纖毛、鞭毛，幫助原生生物移動、滑動和捕獲食物。它有一層類似植物、動物和真菌的細胞膜。營養素的獲取過程是一個混合營養的過程，在獲得食物的過程中涉及到幾種方法。原生生物的呼吸也很不穩定。
它可以透過有氧和厭氧呼吸。原生動物的滲透調節過程非常發達。原生生物的線粒體是從祖先進化而來的。這些線粒體也有保留的基因組。
它仍然是從祖先那裡得到的。真菌類原生生物的菌絲是腔細胞。因為原生生物是原核生物，也就是說，它們不像真核生物那樣高度發達，也沒有真核細胞中存在的一些細胞器。
什麼是真菌(fungi)？
真菌是具有多細胞組織的有機體，其細胞被稱為真核細胞。所有的真菌都有一個細胞壁，它是由甲殼素，一種特殊的多糖。它有一種不同的細胞間組織，如細胞質隔室，並含有參與物質在整個真菌體內連續流動的隔膜。
真菌沒有纖毛、鞭毛等外部結構，這就是為什麼真菌是不可移動的。真菌的營養獲得過程是變化多端的，如腐性、寄生性、肉食性等，它透過根狀體和吸器從屍體中獲取能量，並透過吸器從活體獲取能量。
真菌的呼吸過程不是很複雜。它只是透過有氧呼吸，而在真菌中不存在無氧呼吸。真菌線粒體基因組也減少。
主要區別
- 原生生物具有單細胞組織，而真菌具有多細胞組織。
- 原生生物非常微小，只能用簡單的顯微鏡才能看到，而真菌則足夠大，可以用肉眼看到。
- 一些原生生物有一個類似植物、細菌和真菌的細胞壁；另一方面，真菌有一個由幾丁質構成的細胞壁。
- 一些原生生物不包含細胞壁，而王國真菌的所有成員都有細胞壁。
- 原生生物的細胞是腔細胞，而真菌的細胞是有隔膜和無隔膜的。
- 原生生物在細胞質中不包含隔室，而真菌在細胞質中可能包含或不包含隔室。
- 原生生物大多是能動的，而真菌是不可移動的。
- 一些原生生物的細胞結構上有纖毛和鞭毛；另一方面，真菌的結構中不含有纖毛和鞭毛。
- 在原生生物中，線粒體的基因補體保持不變，而在真菌中，線粒體的基因補體沒有保留。
- 原生生物具有高階滲透調節；另一方面，真菌具有不成熟的滲透調節。
- 在原生生物中，從土壤中獲取養分的過程是混合營養的，而在真菌中，從土壤中獲取養分的過程是腐生的。
- 在原生生物中，線粒體總是保留著基因組，而在真菌中，線粒體總是有基因組的減少。
- 原生生物的細胞膜通常是不同的；另一方面，真菌的細胞膜是由幾丁質構成的。
結論
以上討論的結論是，原生生物和真菌都是分類的兩個領域。原生生物是原核生物，包含在單細胞組織中，而真菌是真核生物，包含在多細胞組織中。
