如何读质粒图谱(read a plasmid map)
质粒图谱是质粒中元素的相对位置。通过了解质粒的特征可以阅读质粒图谱。它们是质粒的名称和大小，质粒的元素，它们的相对位置，以及启动子的方向。复制起源（ORI）、耐药基因、多克隆位点（MCS）、目的基因、启动子区、选择标记和引物结合位点是质粒的组成部分。质粒中元素的相对位置可以通过定位质粒来确定。质粒定位的过程称为限制性定位。
覆盖的关键领域
1.什么是质粒图谱-定义，限制性图谱2.如何读取质粒图谱-质粒图谱的特征
关键词：元件，质粒的名称和大小，启动子的方向，质粒图谱，限制性内切酶，限制性内切酶图谱
什么是质粒图谱(a pla**id map)？
质粒图谱是质粒的图形表示，它显示了质粒的主要标志点或元素的位置。通过限制性内切酶图谱可以确定质粒中各元素的相对位置。限制性图谱是特定质粒内限制性识别位点的图谱。因此，它参与了限制性内切酶对质粒的消化。限制图如图1所示。
Figure 1: Restriction Map
在限制映射中可以使用两种方法：
1.限制消化
–用一种或两种限制性内切酶对质粒进行限制性消化
–根据质粒产生的片段大小绘制质粒图谱
2.排序
–对整个质粒进行测序
–质粒成分的鉴定
如何读取质粒图谱
Figure 2: Pla**id Map
质粒图谱的阅读主要集中在质粒的特征上。他们是；
1.质粒的名称和大小
- 质粒的名称和大小显示在圆形质粒的中间。
2.质粒的成分-
- 复制起源–通过招募细菌转录机制启动复制的DNA序列。
- 抗生素耐药基因-允许在选择性培养基中选择含有质粒的细菌。
- 多克隆位点–由多个限制性识别位点组成的短序列，用于**外源DN**段
- **-**质粒的目的基因
- 启动子区-转录过程中RNA聚合酶的结合位点
- 选择标记–允许选择**基因的成功表达
- 引物结合位点-作为PCR扩增质粒测序的起始位点
3.元素在质粒中的相对位置
- 质粒元件的相对位置通过限制性图谱或测序进行定位。
4.启动子的定位
- 启动子在质粒中的定位对于确定质粒中所有其他元件的定位，尤其是**基因的定位非常重要。转录起始于启动子的3′端。因此，基因应该在正确的方向才能被表达。
结论
通过了解质粒图谱的特征，如质粒的名称、大小、质粒中的元素类型及其相对位置以及启动子的方向等，可以读取质粒图谱。
引用
- 发表于 2021-06-30 14:09
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- 分类：科学
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