双杂交是在两个性状不同的P代（亲代）生物之间进行的育种试验。这种杂交类型中的个体是特定性状的纯合子，或者它们共享一个性状。性状是由称为基因的DNA片段决定的特征。二倍体生物为每个基因遗传两个等位基因。等位基因是有性生殖过程中遗传的基因表达的另一种形式（父母各一种）。

在双杂交杂交中，所研究的每个性状的亲本生物都有不同的等位基因对。父母一方拥有纯合显性等位基因，另一方拥有纯合隐性等位基因。这些个体的遗传杂交产生的后代，或F1代，对于所研究的特定性状来说都是杂合的。这意味着所有F1个体都拥有一个杂交基因型，并表达每个性状的显性表型。

双杂交杂交实例

请看上图。左边的图显示的是单杂交杂交杂交，右边的图显示的是双杂交杂交杂交。在这个双杂交组合中测试的两种不同表型是种子颜色和种子形状。一株植物的黄色种子颜色（YY）和圆形种子形状（RR）显性性状为纯合子-该基因型可表示为（YYRR）-另一株植物的绿色种子颜色和褶皱种子形状（YYRR）显性性状为纯合子隐性性状。

F1代

当黄色和圆形（YYRR）的真育种植物（具有相同等位基因的生物体）与绿色和褶皱种子（YYRR）的真育种植物异花授粉时，如上例所示，由此产生的F1代都将是黄色种子颜色和圆形种子形状（YYRR）的杂合子。图中的单圆形黄色种子代表这一代F1。

f2代

这些F1代植物的自花授粉产生后代，即F2代，在种子颜色和形状的变化中表现出9:3:3:1的表型比。请参见图中所示。这一比例可以用一个Punnett平方来预测，以揭示遗传杂交的可能结果。

在产生的F2代中：大约9/16的F2植株将有圆形、黄色的种子；3/16将有圆形、绿色的种子；3/16将有起皱的黄色种子；1/16的种子会有褶皱，绿色。F2后代表现出四种不同的表型和九种不同的基因型。

基因型和表型

遗传基因型决定个体的表型。因此，植物根据其等位基因是显性还是隐性表现出特定的表型。

一个显性等位基因导致显性表型的表达，但两个隐性基因导致隐性表型的表达。隐性表型出现的唯一途径是基因型拥有两个隐性等位基因或纯合隐性。纯合显性和杂合显性基因型（一个显性和一个隐性等位基因）均表示为显性。

在这个例子中，黄色（Y）和圆形（R）是显性等位基因，绿色（Y）和褶皱（R）是隐性基因。本例的可能表型和可能产生这些表型的所有可能基因型为：

黄色和圆形：YYRR、YYRR、YYRR和YYRR

黄色和褶皱：YYrr和YYrr

绿色和圆形：yyRR和yyRR

绿色和皱纹：yyrr

独立分类

双杂交异花授粉实验使格雷戈·孟德尔发展了他的独立分类法则。这条定律表明，等位基因相互独立地传递给后代。等位基因在减数分裂期间分离，使每个配子具有一个单一性状的等位基因。这些等位基因在受精时随机结合。

双杂交组合与单杂交组合

双杂交组合处理两个性状的差异，而单杂交组合则以一个性状的差异为中心。参与单杂交杂交的亲本生物具有所研究性状的纯合基因型，但这些性状具有不同的等位基因，导致不同的表型。换句话说，一个亲本为纯合显性，另一个为纯合隐性。

与双杂交杂交一样，单杂交杂交产生的F1代植株是杂合子，仅观察到显性表型。由此产生的F2代的表型比为3:1。约3/4表现为显性表型，1/4表现为隐性表型。