偏头痛手术通常在其他治疗方法不成功时作为最后手段使用，因为任何手术都有潜在的并发症。根据头痛的根本原因，有几种类型的偏头痛手术可供选择。最流行的手术包括动脉手术、卵圆孔未闭闭合和触发部位松解。脊髓刺激可能是一个好的选择，为那些遭受多次偏头痛发作每月。关于各种类型的偏头痛手术或个人情况下最合适的程序的任何具体问题或担忧都应与医生或其他医学专业人士讨论。。

动脉手术是偏头痛手术中最常见的一种，适用于颈部颈动脉的一条或多条分支扩大的情况。当这些血管通过外科手术修复后，大多数患者将体验到疼痛缓解以及相关偏头痛症状的停止，如恶心和对光线和声音的敏感性。这种手术的切口通常位于发际线内，这样就不会有明显的疤痕，严重的并发症也很少见。。

卵圆孔未闭闭合术是偏头痛手术的一种形式，用于因出生缺陷导致心脏穿孔的情况。这一缺陷已被证明会导致慢性偏头痛，而传统的治疗方法往往无效。这种手术有很大的风险，因为心脏组织的意外损伤可能导致心脏骤停或死亡。

当头痛被认为是由神经发炎或受损引起时，触发点释放可能被选为偏头痛手术的首选类型。根据受伤的特定神经，触发部位释放可能包括通过手术断开受影响的神经或剪断附近的肌肉并重新连接健康端。部分瘫痪是该手术最常见的并发症之一。

脊髓刺激是为那些每月数次患有严重偏头痛且对其他治疗方案无反应的患者保留的。一种被称为脊髓刺激器的装置通过外科手术植入覆盖脊柱的皮肤下，用于阻断疼痛信号。如果这种治疗方法不能提供足够的疼痛缓解，则可以移除该装置。