尽管坊间有相反的说法，但真正的巧克力过敏是如此罕见，以至于在医学上几乎不存在。可可豆是巧克力的主要成分，当食用巧克力后出现食物过敏症状时，可可豆通常不是罪魁祸首。任何不良反应通常是由巧克力中的另一种成分引起的，而不是巧克力过敏。

巧克力产品往往含有许多人可能会过敏的其他成分。几乎所有的巧克力产品都含有牛奶等乳制品成分，对乳制品过敏很常见，尤其是在幼儿中。对于乳糖不耐受但能耐受少量牛奶的人，苦乐参半、半甜和黑巧克力可能是一种选择。这些巧克力产品需要有更高浓度的巧克力酒，因此比淡巧克力或牛奶巧克力含有更低百分比的牛奶。市场上也有几种品牌的无乳巧克力可供极为敏感的乳糖不耐受症患者食用。。

花生、杏仁、胡桃和山核桃等树坚果也可能是巧克力制品过敏反应的来源。许多糖果和其他巧克力产品含有坚果，但即使那些不含坚果的产品也可能存在问题。一些巧克力制造商在相同的生产线上使用相同的大桶和机器制作糖果，无论最终产品中是否含有坚果。因此，即使不含坚果的巧克力也可能含有微量的坚果肉或油。。

对于那些对坚果极为敏感的人，尤其是那些对花生有严重过敏的人，即使这些微量的坚果产品也会引起严重的反应。此类人员应查阅标签，如果未提及无螺母生产，应联系制造商。目前有几家不含坚果的巧克力生产商，如Nothin'Nutty®和佛蒙特州不含坚果的®巧克力生产商。

巧克力中的玉米可能会引起敏感人群的过敏反应，这可能被误解为巧克力过敏。高果糖玉米糖浆用于许多品牌的巧克力糖果。与坚果一样，许多制造商在生产线生产不含玉米的巧克力。交叉污染几乎是不可能避免的，即使是微量的玉米也会给高度敏感的人群带来风险。

另一个可能导致巧克力过敏的罪魁祸首是大豆。巧克力是一种乳状液，是两种通常会分离的液体的混合物。为了防止成分分离并使巧克力在室温下保持固体状态，通常会添加乳化剂。巧克力产品中最常用的乳化剂是大豆卵磷脂。这种添加剂对大豆过敏的人来说可能有问题。

浆果是盒装巧克力的常用填充物，也是过敏性较高的食物之一。对浆果过敏的人最好避免食用巧克力，以尽量减少接触。咖啡因也可能给那些对这种化学物质敏感的人带来问题。尽管人们普遍认为巧克力中的咖啡因含量相对较低，但仍可能有足够的咖啡因导致高度过敏的人出现问题。需要注意的是，巧克力颜色越深，咖啡因含量越高。。

对小麦或麸质过敏的个人，如患有乳糜泻的人，在食用任何巧克力产品之前，应特别注意标签。带有奶油馅料的巧克力通常使用小麦淀粉或面粉作为粘合剂。市场上有濒危物种巧克力等公司生产的无麸质巧克力。

在极少数情况下，服用处方药百忧解®或其他5-羟色胺再摄取抑制剂（SSRIs）的个人食用巧克力产品可能会导致过敏症状。巧克力会导致某些神经递质的释放，包括血清素。百忧解®和其他SSRIs也会影响大脑中的血清素水平。与巧克力结合，这可能会导致药物相互作用。

食物过敏随时可能出现。如果怀疑对巧克力过敏或其他食物过敏，应咨询医生。如果症状严重，包括突然出疹、脉搏急促或呼吸困难，应寻求紧急医疗服务。主治医师或过敏症医生应确切了解所使用的产品，以及是否涉及任何处方或非处方药。