基因先锋j。克雷格·文特创造了最小的细菌基因组

基因组开拓者J。克雷格·文特和一组研究人员现在已经为细菌创造了一个最小的基因组——一个只包含473个基因的基因组,比已知最小的自然存在的细菌有机体还少。新的基因组可能有助于为科学家提供关键的线索,即哪些基因是生命所必需的。...

基因组开拓者J。克雷格·文特和一组研究人员现在已经为细菌创造了一个最小的基因组——一个只包含473个基因的基因组,比已知最小的自然存在的细菌有机体还少。新的基因组可能有助于为科学家提供关键的线索,即哪些基因是生命所必需的。

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这项发表在《科学》杂志上的研究表明,基础生物学缺失了三分之一被认为是生命必需的基因。文特尔将确定关键和非关键基因的过程比作试图解构波音777,以找出其工作原理。”他在接受记者采访时说:“你可以从右翼拆下发动机,注意到它可以飞行和着陆。”在左侧机翼上的发动机也拆下之前,您不会注意到这一点。

得克萨斯大学奥斯汀分校副教授布雷特·贝克说:“相当不可思议”“相当不可思议。”。他没有参与这项研究。”他们正在对所有的基因进行分类,找出哪些基因是生命所必需的,这是相当惊人的,他们发现了很多。“这些功能未知的基本基因是未来研究的好目标,贝克说。他们也许能够告诉研究人员更多关于生命的基本组成部分,因为基因组学最大的问题之一是科学家不知道大多数基因的功能。

这项工作没有任何直接的应用,尽管最终可能会有工业用途,如生物燃料和农业。文特尔说,主要目的是提供知识。他说,了解到三分之一的重要基因具有未知的功能“是一个关键的发现,即使这种生物没有其他用途。”。

基因先锋j。克雷格·文特创造了最小的细菌基因组

(C。比克尔/科学)

不过,文特尔的团队并没有从零开始创造生命。相反,他们从一个现存的有机体中挑选基因,作为2010年发表在《科学》杂志上的工作的扩展。那时文特的研究小组合成了一种名为支原体的细菌中唯一的染色体。研究人员用他们的人工基因替换了另一种细菌支原体capricolum的DNA,创造了他们称之为SYN1.0的基因。当时,它是有史以来合成的最大的DN**段,也是第一次任何合成的DNA都精确到足以取代细胞的原始DNA。

下一步是确定生命和生殖所需的最小基因数。为了做到这一点,研究人员开始从syn1.0中切下基因——利用当时关于哪些基因被认为是生命所必需的知识。他们用这种方法创造了两个可能的基因组。移植到M。capricolum细胞。

在下一步的研究中,研究小组将syn1.0的901个基因分为八个部分,在重组DNA并将其移植到细胞中之前开始去除大块的基因。如果细胞死了,他们会移除一些重要的东西。这种实验方法最终导致了Syn 2.0,一种基因比任何独立生物都少的微生物,然后是今天的Syn 3.0,基因比任何独立生物都少。

麻省理工学院生物工程教授克里斯托弗·沃伊特(Christopher Voigt)表示,这是一个“大跃进”,使syn3.0成为2010年论文中的“大跃进”(他不是一个研究作者。)虽然其他人在过去**了最小的基因组,工程方法也不是新的,但文特的团队重组细胞DNA的方式拥有“所有人类设计元素——简单、模块化、有组织——但在活细胞中仍然可行,“沃伊特在基因专家新闻处的新闻稿中说。”如果人类设计师能够创造出一种有序的、结构化的替代物,来替代自然界中如何发现生命的方式,那就说明生物学的复杂性仅仅是进化如何塑造它的人工制品。”

伯克利合成生物学研究所所长亚当·阿金说,文特尔团队使用的方法也是遗传学研究的一个重要方法。他在一封电子邮件中写道,通过试图切掉任何不重要的东西,研究小组发现“即使在最小的基因组中,也有大量的惊喜,而这些基因组是通过观察基因组序列无法发现的。”这是一个深刻的结果,表现得非常优雅。”

生物体的最小基因组在一定程度上取决于它稳定的实验室环境——它生长的介质比自然环境要均匀得多。因此,生物体需要较少的基因来应对温度波动或食物来源。正如文特尔在记者招待会上承认的那样,syn3.0还包含了一些基因,这些基因可以使syn3.0快速生长,成为一个好的实验室模型(他说,这些基因可能已经被敲除,但之后还需要5年时间才能完成这项研究。)知道它将在什么样的实验室培养基中,才能敲除可能与其他环境相对应的基因。”文特说,每一个基因组都是特定环境的,取决于环境中的化学物质没有上下文就没有真正的最小基因组。”

  • 发表于 2021-05-04 00:00
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