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shRNAとsiRNAの比較
RNA干渉は、低分子干渉RNA(siRNA)、ショートヘアピンRNA(shRNA)、二重機能性shRNAを含む自然なプロセスです。現在、RNAiは個別化がん治療のツールとして広く用いられています。化学的に合成された二本鎖のsiRNAとベクターshRNA分子。この2つの分子は、機能的な成果は似ていますが、構造が異なるため、作用機序、RNA経路、ターゲティング効果も異なります。
シャイナ
shRNAは、RNAiの際に標的遺伝子の発現を抑制するために使用できる低分子RNA分子の配列である。shRNAの発現は、ウイルスや細菌、プラスミドなどのベクターによって実現される。核で合成され、細胞質へ運ばれ、さらに処理される。これらの分子は類似したmiRNAの成熟経路を持つため、miRNAの合成はshRNAの合成を理解するための基礎となります。RNAポリメラーゼIIまたはIIIは、RNAポリメラーゼIIまたはIIIプロモーターを通じてshRNAを転写します。shRNAを使う利点は、分解と回転の割合が比較的低いということです。デメリットとしては、発現ベクターが必要であり、安全性に問題がある可能性があること。
エスアールエヌエー
sirnaは20-25塩基からなる二本鎖のRNA分子である。RNAi経路の中で、相補的な塩基配列を持つ遺伝子をサイレンシングすることで、遺伝子を抑制する。siRNAを導入した遺伝子のノックダウンは、一過性の効果であり、特に急速に分裂する細胞では、抑制**があまり長く続かないため、通常成功しない。この問題を解決するために、siRNAは短いヘアピン構造を導入することで改変されています。この修飾された分子をshRNAと呼びます。shRNAはダイシングによってsiRNAに変換され、正常な機能を継続する必要があります。
shRNAとsiRNAの違いは何ですか?
-shRNAは、siRNAと異なり、ヘアピン構造が付加されている。
-shRNAは発現ベクターを必要とするが、siRNAは必要としない。
-shRNAは長期のノックダウンに使用できるが、siRNAは短期間の遺伝子ノックダウンにしか使用できない。
-siRNAの遺伝子抑制とは異なり、shRNAの抑制は長期間持続するため、適切なウイルスベクター**に通せば、永久的な遺伝子抑制効果をもたらす可能性があります。