shRNA vs siRNA
在RNA干擾(RNAi)過程中,靶基因的表達以高度的特**和選擇性被抑制。RNA干擾是一個自然過程,涉及小干擾RNA(siRNA)、短髮夾RNA(shRNA)和雙功能shRNA。目前,RNAi作為個體化癌症治療的工具被廣泛應用。RNAi的應用基本上是通過化學合成的雙鏈siRNA和載體shRNA分子來實現的。儘管這兩個分子具有相似的功能結果,但它們的結構不同;因此,這兩個分子的作用機制、RNA途徑和靶向效應也不同。
什娜
shRNA是一個小RNA分子序列,在RNAi過程中可以用來使靶基因表達沉默。shRNA的表達是通過載體實現的,載體可以是病毒或細菌,也可以是質粒。它們在細胞核中合成,並運輸到細胞質中進行進一步的加工。這些分子具有相似的miRNA成熟途徑,因此miRNA的合成為理解shRNA的合成提供了基礎。RNA聚合酶II或III均可通過RNA聚合酶II或III啟動子轉錄shRNA。使用shRNAs的優點是它們的降解率和週轉率相對較低。缺點是它需要一個表達式向量,這可能會導致一些安全問題。
siRNA
sirna是由20-25個鹼基組成的雙鏈RNA分子。它們通過沉默RNAi途徑中任何具有互補核苷酸序列的基因來抑制基因。轉染siRNA的基因敲除通常是不成功的,這是由於短暫的效應;尤其是在快速分裂的細胞中,抑**用不會持續更長時間。為了克服這個問題,siRNA通過引入一個短髮夾結構進行了修飾。這種經過修飾的分子被稱為shRNA。shRNA應通過骰子轉化為siRNA,以繼續其正常功能。
shRNA和siRNA的區別是什麼?
•與siRNA不同,shRNA具有額外的髮夾結構。shRNA是siRNA的改良版本。
•shRNA需要表達載體,而siRNA不需要。
•shRNA可用於長期敲除,而siRNA只能用於基因的短期敲除。
•與siRNA的基因抑制不同,shRNA的抑制是持久的,如果通過適當的病毒載體**,它可能產生永久的基因沉默效果。