主要區別
環光磷酸化只產生ATP，磷酸化是將磷酸基團加入到化合物或分子中的機制。它發生在所有生物中，但光磷酸化是一種只發生在植物和一些細菌（而不是在人類）中的磷酸化型別。其次，迴圈光磷酸化是涉及迴圈電子傳輸的過程，而非迴圈光磷酸化是不涉及迴圈電子傳輸的過程。這兩個過程的另一個顯著區別是，迴圈光磷酸化只產生ATP，而非迴圈則同時產生ATP和NADP。
比較圖
什麼是環光磷酸化(cyclic photophosphorylation)？
光合磷酸化是一個包含電子迴圈傳輸的過程，其反應的活性中心是photosystemm1（P700），它不涉及photosystemm2（P680）。迴圈光磷酸化涉及光系統1，在這個過程中，電子以迴圈方式移動並返回光系統1。在這個過程中，三磷酸腺苷（ATP）被植物用作能量來源，這種ATP被用於卡爾文迴圈。卡爾文迴圈的過程直接依賴於ATP的存在，如果沒有足夠的ATP，這個過程就不會繼續下去。迴圈光磷酸化不涉及氧氣的產生，光解（水分裂）在這方面也不存在。此外，這個過程不產生NADP和氧氣，但仍然產生ATP。迴圈光合磷酸化過程主要發生在細菌中，在植物中較少見到。
什麼是非迴圈光磷酸化(non cyclic photophosphorylation)？
光合磷酸化過程沒有電子的迴圈運輸，其反應的活性中心是光系統2（P680），但也涉及光系統1（P700）。在非迴圈光磷酸化中。電子的輸運是以非迴圈的方式進行的，這些來自光系統1（P700）的電子被NADP接受。在非迴圈光合磷酸化過程中，產生ATP和NADP作為能量源（NADP是一種豐富的能量源，因為1個NADP提供的能量相當於3個ATP）。在非迴圈光合磷酸化反應中，氧作為反應的副產物被演化出來，最終在周圍環境中被釋放出來，它在其中也有光解作用，或者存在水分裂。非迴圈光合磷酸化過程主要發生在綠色植物中。
環光磷酸化(cyclic photophosphorylation) vs. 非迴圈光磷酸化(non cyclic photophosphorylation)
- 迴圈光磷酸化具有迴圈電子傳遞，而非迴圈光磷酸化具有非迴圈電子傳遞順序。
- 環光合磷酸化有活性中心P700，而非環光磷酸化有活性中心
- 迴圈光磷酸化只涉及光系統1，而非迴圈光磷酸化涉及其中的光系統1和光系統2。
- 迴圈光磷酸化只產生ATP，但與此相反，非迴圈光磷酸化同時產生ATP和NADP。
- 在迴圈光磷酸化中，電子返回光系統1，而在非迴圈光磷酸化中，來自光系統1的電子被NADP接受。
- 迴圈光磷酸化不產生氧，不包含水的光解作用，而非迴圈光磷酸化則消除了作為反應副產物的氧，並且在其中對水進行了光解。
- 迴圈光磷酸化產生ATP而不產生氧氣和NADP，而非迴圈光磷酸化產生ATP、NADP和氧氣。
- 迴圈光磷酸化主要發生在細菌中，而非迴圈光磷酸化主要發生在綠色植物中。
