主要区别
环光磷酸化只产生ATP，磷酸化是将磷酸基团加入到化合物或分子中的机制。它发生在所有生物中，但光磷酸化是一种只发生在植物和一些细菌（而不是在人类）中的磷酸化类型。其次，循环光磷酸化是涉及循环电子传输的过程，而非循环光磷酸化是不涉及循环电子传输的过程。这两个过程的另一个显著区别是，循环光磷酸化只产生ATP，而非循环则同时产生ATP和NADP。
比较图
什么是环光磷酸化(cyclic photophosphorylation)？
光合磷酸化是一个包含电子循环传输的过程，其反应的活性中心是photosystemm1（P700），它不涉及photosystemm2（P680）。循环光磷酸化涉及光系统1，在这个过程中，电子以循环方式移动并返回光系统1。在这个过程中，三磷酸腺苷（ATP）被植物用作能量来源，这种ATP被用于卡尔文循环。卡尔文循环的过程直接依赖于ATP的存在，如果没有足够的ATP，这个过程就不会继续下去。循环光磷酸化不涉及氧气的产生，光解（水分裂）在这方面也不存在。此外，这个过程不产生NADP和氧气，但仍然产生ATP。循环光合磷酸化过程主要发生在细菌中，在植物中较少见到。
什么是非循环光磷酸化(non cyclic photophosphorylation)？
光合磷酸化过程没有电子的循环运输，其反应的活性中心是光系统2（P680），但也涉及光系统1（P700）。在非循环光磷酸化中。电子的输运是以非循环的方式进行的，这些来自光系统1（P700）的电子被NADP接受。在非循环光合磷酸化过程中，产生ATP和NADP作为能量源（NADP是一种丰富的能量源，因为1个NADP提供的能量相当于3个ATP）。在非循环光合磷酸化反应中，氧作为反应的副产物被演化出来，最终在周围环境中被释放出来，它在其中也有光解作用，或者存在水分裂。非循环光合磷酸化过程主要发生在绿色植物中。
环光磷酸化(cyclic photophosphorylation) vs. 非循环光磷酸化(non cyclic photophosphorylation)
- 循环光磷酸化具有循环电子传递，而非循环光磷酸化具有非循环电子传递顺序。
- 环光合磷酸化有活性中心P700，而非环光磷酸化有活性中心
- 循环光磷酸化只涉及光系统1，而非循环光磷酸化涉及其中的光系统1和光系统2。
- 循环光磷酸化只产生ATP，但与此相反，非循环光磷酸化同时产生ATP和NADP。
- 在循环光磷酸化中，电子返回光系统1，而在非循环光磷酸化中，来自光系统1的电子被NADP接受。
- 循环光磷酸化不产生氧，不包含水的光解作用，而非循环光磷酸化则消除了作为反应副产物的氧，并且在其中对水进行了光解。
- 循环光磷酸化产生ATP而不产生氧气和NADP，而非循环光磷酸化产生ATP、NADP和氧气。
- 循环光磷酸化主要发生在细菌中，而非循环光磷酸化主要发生在绿色植物中。
