關鍵區別-蛋白質組學與轉錄組學
組學技術是當前的一種趨勢,在這種技術中,生物體的不同生物分子被視為一個整體,涉及其性質和功能。omic技術有著廣泛的應用。生物樣品的不同組學包括基因組學、蛋白質組學、轉錄組學和代謝組學。蛋白質組學是對生物體內所有蛋白質的全面研究。它被定義為生物體內所有表達的蛋白質的集合,它的結構和功能特性。因此,全套蛋白質形成了蛋白質組。轉錄組學是對生物體內所有信使RNA(mRNA)分子的完整研究。因此,轉錄組學研究的是在生物體內活躍表達的基因。一個生物體內的全部mRNA被稱為轉錄組。蛋白質組學和轉錄組學的關鍵區別在於生物分子的類型。在蛋白質組學中,研究的是一個活的有機體中表達的全部蛋白質,而在轉錄組學中,研究的是一個活的有機體的總mRNA。
目錄
1. 概述和主要區別
2. 什麼是蛋白質組學
3. 什麼是轉錄組學
4. 蛋白質組學與轉錄組學的相似性
5. 並列比較-蛋白質組學與表格式轉錄組學
6. 摘要
什麼是蛋白質組學(proteomics)?
蛋白質組學一詞於1995年提出,最初定義為細胞、組織或有機體中的總蛋白補體。隨著蛋白質組學研究的進展,它被修改為一個包含許多研究領域的總括術語。目前,蛋白質組學主要研究蛋白質的結構、取向、功能、相互作用、修飾、應用和重要性。因此,目前在蛋白質組學領域進行了大量的研究。
首次進行蛋白質組學研究,以鑑定大腸桿菌中的蛋白質含量。用二維凝膠繪製總蛋白含量。在這項研究成功之後,科學家們開始研究豚鼠和老鼠等動物體內的總蛋白質含量。目前,人類蛋白質定位是用二維凝膠電泳進行的。
蛋白質組學應用
蛋白質組學的研究有很多優點,因為蛋白質的催化特性決定了蛋白質是大多數活性的控制分子。因此,對整個蛋白質的研究可以提供有關生物體健康狀況的信息。一些應用是;
- Genome annotation: By studying the protein content of an organi**, the exact genomes resp***ible for the active protein compound can be determined. In this scenario results from all genomics, Transcriptomics and proteomics are important.
- Disease identification / Diagnostics: Proteomics is used in the identification of the disease condition, by comparing the healthy and the diseased
- To carry out protein expression studied during experimentation.
- Protein modificati*** and interaction studies: In order to use proteins in vitro conditi*** or and in vivo conditi***, to decide the storage conditi*** of these extracted proteins and to study the behaviour of the protein in in vitro, in vivo and in – silico methods.
蛋白質組學涉及不同的技術
- Extraction of the total protein and separating the proteins using 2D gel electrophoresis. Proteins can also be separated using High-Performance Liquid Chromatography (HPLC).
- Sequencing of the extracted proteins using methods such as Edmund’s sequencing method or Mass spectrometry.
- Once the sequences are identified, structural and functional properties of the protein content are ****yzed using computer-based software and bioinformatics tools.
什麼是轉錄組學(transcriptomics)?
轉錄組這一術語是最近發明的。轉錄組學是研究有機體總mRNA含量的學科。總mRNA是生物體或細胞中表達的DNA。完整的mRNA集合稱為轉錄組。
分析轉錄組的步驟包括:,
- Extraction of RNA, separation of mRNA using column gel chromatography with poly DT beads.
- The sequencing of the mRNA is done.
微陣列技術是鑑定生物體轉錄組的一種常用方法。微陣列技術包括一個帶有轉錄組互補鏈的探針板。雜交後,可以對存在於生物體或細胞中的mRNA進行鑑定。
轉錄組學已廣泛應用於醫學領域。疾病診斷和疾病分析是轉錄組學應用的主要領域。通過分析一個有機體的轉錄組,可以識別出外來的mRNA,如果有感染,就可以鑑定出來。非編碼RNA可以使用轉錄組技術分離。並可監測不同環境脅迫下基因的表達。
蛋白質組學(proteomics)和轉錄組學(transcriptomics)的共同點
- 兩者都構成了經濟技術概念的一部分。
- 二者都用於疾病診斷和生物體的疾病特徵描述。
- 這兩個研究領域都涉及生物分子的提取、分離和測序步驟。
蛋白質組學(proteomics)和轉錄組學(transcriptomics)的區別
蛋白質組學與轉錄組學 | |
蛋白質組學是對生物體內所有蛋白質的全面研究。 | 轉錄組學是對生物體內所有信使RNA(mRNA)分子的完整研究。 |
研究生物分子類型 | |
蛋白質組學研究蛋白質。 | mRNA在轉錄組學中被研究。 |
研究因素 | |
蛋白質組學主要研究蛋白質的結構、功能、相互作用、修飾和應用。 | 研究了mRNA的序列結構、與環境的相互作用及其在轉錄組學中的應用。 |
總結 - 蛋白質組學(proteomics) vs. 轉錄組學(transcriptomics)
組學在生命科學領域發揮著重要作用。蛋白質組學是指在細胞或生物體內形成完整的蛋白質集合的蛋白質組學。轉錄組學是指對轉錄組的研究,轉錄組是以mRNA形式表達的一整套DNA。蛋白質組學和轉錄組學這兩個研究領域是在引入基因組學之後發展起來的,目前廣泛應用於醫學診斷和生物體的鑑定和篩選。這就是蛋白質組學和轉錄組學的區別。
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引用
1.霍根、理查德·P和路易絲·C·肯尼。“組學技術:基因組學、轉錄組學、蛋白質組學和代謝組學”,《婦產科醫生》,Blackwell出版公司,2011年7月18日。可在2.Graves,Paul R.和Timothy A.J.Haystead獲取。“蛋白質組學分子生物學家指南”,《微生物學和分子生物學評論》,美國微生物學學會,2002年3月。可在此處查閱3。Lowe,Rohan等人。“轉錄組學技術”,《公共科學圖書館公共科學》計算生物學,2017年5月。可在此處查閱
2.格雷夫斯,保羅·R.和蒂莫西·A·J·海斯特德。“蛋白質組學分子生物學家指南”,《微生物學與分子生物學評論》,美國微生物學學會,2002年3月
3.Lowe,Rohan等人。“轉錄組學技術”,公共科學圖書館,公共科學圖書館,2017年5月