shotgun測序與下一代測序的關鍵區別在於,shotgun測序是一種將DNA序列隨機分解成許多小片段並通過觀察重疊區域來重組序列的測序方法,而next next generation sequencement(NGS)則是一種先進的基因測序方法這取決於毛細管電泳。
測序是確定一個基因、一組基因、染色體和一個完整基因組中核苷酸精確順序的過程。基因結構與功能分析和生物鑑定在基因組學、法醫學、病毒學、生物系統學、醫學診斷、生物技術等諸多領域都具有重要意義。此外,還有不同類型的測序方法可用。鳥槍測序和下一代測序是其中兩種先進的測序方法。
目錄
1. 概述和主要區別
2. 什麼是***測序
3. 什麼是下一代測序
4. 鳥槍測序與下一代測序的相似性
5. 並列比較——***測序與下一代列表測序
6. 摘要
什麼是**槍測序(shotgun sequencing)?
鳥槍測序是一種通過觀察重疊的序列或區域,將整個染色體或整個基因組的DNA序列隨機地分解成許多小片段,並通過計算機重新組合序列的方法。一般來說,哺乳動物基因組結構複雜,體積較大。因此,很難通過克隆來對它們進行測序,因為這很耗時。**槍測序是一種更快的方法。這樣做也更便宜。因此,現代科學家依靠鳥槍測序方法來解決複雜的基因組問題。
**槍測序程序相對簡單。它首先將整個基因組分成20千鹼基到300千鹼基不等的大小。然後用鏈終止法對每個片段進行測序。測序後,有必要使用複雜的計算機軟件通過觀察重疊區域來組裝片段。這種方法不需要常規的序列定位和克隆。此外,該方法沒有使用遺傳圖譜。然而,由於沒有使用現有的基因組圖,在組裝過程中更容易出現錯誤。這是這種方法的主要缺點之一。此外,在這種方法中,較短的片段為每次讀取提供的唯一信息較少。此外,**槍測序無法產生足夠的數據,以所需的準確度標準確定一致的序列。
儘管有上述缺點,鳥槍測序法是目前最有效和最具成本效益的微生物基因組測序方法,包括細菌、病毒和酵母。這是因為它們的基因組缺少難以測序的重複區域,而且很容易將這些基因組組裝成染色體而不會出錯。
什麼是下一代測序(next generation sequencing)?
下一代測序(NGS)是一個用來指代現代高通量測序過程的術語。它描述了許多不同的現代測序技術,這些技術革新了基因組研究和分子生物學。這些技術包括Illumina測序、羅氏454測序、離子質子測序和固體(寡連接檢測測序)測序。NGS系統更快、更便宜。四種主要的DNA測序方法用於NGS系統:焦測序、合成測序、連接測序和離子半導體測序。大量的DNA或RNA鏈(數百萬)可以被NGS並行測序。它允許在短時間內對生物體的整個基因組進行測序。
NGS有不同的優勢。這是一個快速,更準確和成本效益高的過程,可以執行小樣本量。因此,它可以在單個測序實驗中分析整個人類基因組。此外,NGS可用於宏基因組研究,檢測單個基因組中由於**和缺失等原因而產生的變異,以及基因表達的分析。此外,NGS可以同時分析大量組織的整個轉錄組。因此,NGS徹底改變了轉錄組的分析。
**槍測序(shotgun sequencing)和下一代測序(next generation sequencing)的共同點
- 鳥槍測序和下一代測序是兩種基因組測序方法。
- 兩種方法都是快速方法。
- 此外,它們是成本效益高的方法。
- 他們能夠同時對許多DN**段進行測序。
**槍測序(shotgun sequencing)和下一代測序(next generation sequencing)的區別
總結 - **槍測序(shotgun sequencing) vs. 下一代測序(next generation sequencing)
鳥槍測序和下一代測序是基因組測序中常用的兩種測序方法。這兩種方法都是快速且經濟有效的方法。NGS的工作原理是通過測序系統快速地同時對數百萬個序列進行測序。相比之下,鳥槍測序需要將基因組分成小片段,並使用重疊序列進行測序和重組。因此,本文總結了鳥槍測序和下一代測序的區別。
引用
1《複雜基因組:鳥槍測序》自然新聞,自然出版集團,可在這裡獲得。Behjati,Sam和Patrick S Tarpey。“什麼是下一代測序?兒童疾病檔案。教育與實踐版,BMJ出版集團,2013年12月,可在此處獲取。
2Behjati,Sam和Patrick S Tarpey。“什麼是下一代測序?兒童疾病檔案。教育實踐版,BMJ出版集團,2013年12月,