關鍵區別-微陣列與下一代測序
DNA測序技術廣泛應用於生物技術、病毒學、醫學診斷和法醫學等領域。它是一個確定DNA分子中核苷酸、腺嘌呤、鳥嘌呤、胸腺嘧啶和胞嘧啶的確切順序的過程。DNA測序程序已成為醫學和生物學研究中奇蹟性發現的促進劑。這些測序方法已經發展到對包括人類和其他生物在內的單個生物體的完整基因組進行測序。微陣列和下一代測序是現代DNA測序程序。微陣列技術是基於包含一組已知靶點的雜交技術。下一代測序是基於合成(利用DNA聚合酶結合核苷酸),並且能夠獨立於先前選擇的靶點對整個基因組進行測序。這是微陣列和下一代測序的關鍵區別。
目錄
1. 概述和主要區別
2. 什麼是微陣列
3. 什麼是下一代測序
4. 微陣列與下一代測序的相似性
5. 並列比較-微陣列與下一代列表測序
6. 摘要
什麼是微陣列(microarray)?
DNA微陣列作為一種實驗室工具,可以同時識別數千種不同的基因表達。它是一個固體表面,即顯微鏡載玻片,上面有一系列微小的DNA斑點。每個印刷點包含一個已知的基因序列或一個基因。這些已知的探針印在載玻片上作為探針,以檢測基因表達。這被稱為轉錄組。兩條DNA鏈之間的雜交是微陣列的主要原理。它是核酸序列與氫鍵形成的互補鹼基配對。
最初,信使核糖核酸分子是從實驗樣本和健康人的參考樣本中採集的。實驗樣本來自患病的個體;例如,患有癌症的個體。一旦獲得,兩個mRNA樣本都轉化為cDNA(互補DNA)。接下來,用熒光探針標記每個樣品。熒光探針的顏色不同,以區分樣本cDNA和參考cDNA。為了啟動cDNA分子與微陣列載玻片的結合,將兩個樣品混合在一起。雜交是將cDNA分子連接到微陣列載玻片上的DNA探針上的過程。一旦雜交完成,就會發生一系列反應,根據基因的表達量來鑑定和測量每個基因的表現,這些基因的顏色不同。微陣列的結果被用來建立一個基因表達譜,可以用來識別不同的疾病狀況。
什麼是下一代測序(next generation sequencing)?
下一代測序是一種先進的遺傳測序方法。其原理類似於桑格測序,後者依賴於毛細管電泳。在NGS中,基因組鏈片段化並連接到模板鏈上。每一條鏈的鹼基都是通過連接過程中發出的信號來識別的。Sanger測序法包括測序、分離和檢測三個步驟。由於這些單獨的步驟,樣品製備的自動化在處理量上受到限制。在NGS中,該技術採用基於陣列的測序技術,結合Sanger測序的步驟,可以使數百萬個反應序列同時並行執行,從而以較低的成本實現了高速度和吞吐量。
NGS由三個步驟組成:文庫準備(使用隨機DN**段創建文庫)、擴增(使用克隆擴增和PCR擴增文庫)和測序。使用Sanger測序程序進行的基因組測序過程可以在使用NGS的幾小時內完成。
什麼是微陣列與下一代測序的相似性(the similarity between microarray and next generation sequencing)?
- 微陣列和下一代測序都是使用基於陣列的測序技術開發的。
微陣列(microarray)和下一代測序(next generation sequencing)的區別
微陣列與下一代測序 | |
微陣列是附著在固體表面上的微小DNA點的集合,用來同時測量大量基因的表達水平。 | NGS(Next generation sequencing,下一代測序)是一種基於非Sanger的高通量DNA測序技術,它可以使數百萬或數十億條DNA鏈並行測序。 |
與抗原的相互作用 | |
微陣列是基於由一組已知靶點組成的雜交技術。 | NGS基於DNA聚合酶結合核苷酸的合成,與先前選擇的靶點無關。 |
總結 - 微陣列(microarray) vs. 下一代測序(next generation sequencing)
在研究的背景下,DNA測序已經成為一種重要的促進劑。它廣泛應用於生物技術、醫學診斷和法醫學研究。它已經發展成為更高效和快速的測序程序。微陣列和NGS是目前兩種先進的DNA測序技術。這兩種方法都是基於數組的。微陣列技術依賴於雜交,而NGS則基於合成,即利用DNA聚合酶結合核苷酸。這是微陣列和下一代測序的主要區別。
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引用
1.貝哈提、薩姆和帕特里克的塔皮。“什麼是下一代測序?兒童疾病檔案。教育與實踐版,BMJ出版集團,2013年12月,可在此處獲取。訪問日期:2017年8月23日。Bumganner,Roger。“dna微陣列概述”,當前分子生物學協議,John Wiley and S*** Inc.,2016年2月9日,可在此處查閱。2017年8月23日查閱。3.“DNA微陣列技術”,國家人類基因組研究所(NHGRI),可在此處查閱。訪問日期:2017年8月23日。
2.邦加納,羅傑。“dna微陣列概述”,《分子生物學中的當前協議》,John Wiley and S*** Inc.,2016年2月9日,
3.“DNA微陣列技術”,國家人類基因組研究所(NHGRI),