分層鳥槍測序和全基因組鳥槍測序的關鍵區別在於,在分層鳥槍測序中,基因組在測序前被分成較大的片段,而在全基因組鳥槍測序中,整個基因組被分成小片段進行測序。
測序是分子過程中的一項重要技術,特別是在物種的精確鑑定中。事實上,它是一種識別基因或基因組中核苷酸精確順序的技術。有許多測序技術。其中包括Maxam-Gilbert方法、Sanger方法和自動Sanger方法。
目錄
1. 概述和主要區別
2. 什麼是分層***排序
3. 什麼是全基因組鳥槍測序
4. 分層和全基因組鳥槍測序的相似性
5. 並列比較-以表格形式進行的分層和全基因組鳥槍式測序
6. 摘要
什麼是分層***排序(hierarchical shotgun sequencing)?
分層**槍測序是測序的一種方法。它也被稱為“自上而下的排序”。此外,該方法包括兩個步驟:第一步是基因組擴增,第二步是基因組片段化。在這種方法中,基因組首先被剪切成大片段。然後用載體或人工染色體將這些大片段克隆到不同的宿主中。然後,將這些重組載體排列到一個文庫中。在鳥槍測序過程中,重組載體克隆分別進行測序。克隆中的片段經過限制性消化以進一步縮小基因組的大小,從而進行測序。
在分層**槍測序過程中,大塊碎片必須在**槍測序之前按順序排列。它是在克隆過程中結合的分子標記的幫助下發生的。
分層鳥槍測序創造了一個低分辨率的基因圖譜。但它創造了一個有序的序列圖。因此,它比直接測序需要更長的時間。整個過程由於重組載體庫的建立而延遲。它也是一種勞動密集型技術。然而,目前,這項技術是自動化的,以簡化工作。
什麼是全基因組鳥槍測序(whole genome shotgun sequencing)?
全基因組鳥槍測序是一個單步測序過程。在這個過程中,整個基因組首先發生剪切。接下來,這些小片段中的每一個都會隨機進行測序。測序完成後,進行序列分析。在序列分析過程中,重疊的序列被刪除,並且分析不是一個有序的過程。因此,與分層***測序相比,序列組裝是一個效率較低的過程。然而,全基因組鳥槍式測序的過程更為迅速,而且整個基因組的分析可以在單個實例中進行。
等級制(hierarchical)和全基因組鳥槍測序(whole genome shotgun sequencing)的共同點
- 分層測序和全基因組鳥槍測序是兩種測序方法。
- 兩種方法都要進行桑格測序或自動桑格測序方法。
- 它們參與DNA和RN**段的測序。
- 此外,這兩種方法在分子診斷和研究目的中都很重要。
- 目前,這兩種技術都是自動化的或基於計算機的。
- 這兩種技術都依賴於基因組的碎片化。
等級制(hierarchical)和全基因組鳥槍測序(whole genome shotgun sequencing)的區別
與全基因組鳥槍測序相比,分層鳥槍測序產生更大尺寸的片段,後者只處理小片段的序列。所以,這就是分層測序和全基因組鳥槍測序的關鍵區別。此外,分層鳥槍測序包括兩個主要步驟,而全基因組鳥槍測序依賴於一個主要步驟。
此外,分層鳥槍測序和全基因組鳥槍測序的另一個區別是,與分層鳥槍測序相比,全基因組鳥槍測序的分辨率更高。
下面的信息圖總結了分層和全基因組鳥槍測序的區別。
總結 - 等級制(hierarchical) vs. 全基因組鳥槍測序(whole genome shotgun sequencing)
分層測序和全基因組鳥槍測序是兩種大基因組測序技術。分層鳥槍序列是一個兩步的測序過程,其中基因組被分成更大的片段。相比之下,全基因組鳥槍測序是一個單步測序,其中基因組被分成小片段並直接測序。因此,這就是分層測序和全基因組鳥槍測序的關鍵區別。此外,兩種技術之間的技術方面可能有所不同。
引用
1Waterston,Robert H等。《人類基因組測序》,美國國家科學院院刊,2002年3月19日,可在這裡查閱。夥計,希塔。“基因組測序”,LinkedIn SlideShare,2014年11月4日,可在此處查閱。
2夥計,希塔。“基因組測序”,LinkedIn SlideShare,2014年11月4日,