等級制(hierarchical)和全基因組鳥槍測序(whole genome shotgun sequencing)的區別

分層鳥槍測序和全基因組鳥槍測序的關鍵區別在於,在分層鳥槍測序中,基因組在測序前被分成較大的片段,而在全基因組鳥槍測序中,整個基因組被分成小片段進行測序。...

分層鳥槍測序和全基因組鳥槍測序的關鍵區別在於,在分層鳥槍測序中,基因組在測序前被分成較大的片段,而在全基因組鳥槍測序中,整個基因組被分成小片段進行測序。

測序是分子過程中的一項重要技術,特別是在物種的精確鑑定中。事實上,它是一種識別基因或基因組中核苷酸精確順序的技術。有許多測序技術。其中包括Maxam-Gilbert方法、Sanger方法和自動Sanger方法。

目錄

1. 概述和主要區別
2. 什麼是分層***排序
3. 什麼是全基因組鳥槍測序
4. 分層和全基因組鳥槍測序的相似性
5. 並列比較-以表格形式進行的分層和全基因組鳥槍式測序
6. 摘要

什麼是分層***排序(hierarchical shotgun sequencing)?

分層**槍測序是測序的一種方法。它也被稱為“自上而下的排序”。此外,該方法包括兩個步驟:第一步是基因組擴增,第二步是基因組片段化。在這種方法中,基因組首先被剪切成大片段。然後用載體或人工染色體將這些大片段克隆到不同的宿主中。然後,將這些重組載體排列到一個文庫中。在鳥槍測序過程中,重組載體克隆分別進行測序。克隆中的片段經過限制性消化以進一步縮小基因組的大小,從而進行測序。

等級制(hierarchical)和全基因組鳥槍測序(whole genome shotgun sequencing)的區別

圖01:分層***排序

在分層**槍測序過程中,大塊碎片必須在**槍測序之前按順序排列。它是在克隆過程中結合的分子標記的幫助下發生的。

分層鳥槍測序創造了一個低分辨率的基因圖譜。但它創造了一個有序的序列圖。因此,它比直接測序需要更長的時間。整個過程由於重組載體庫的建立而延遲。它也是一種勞動密集型技術。然而,目前,這項技術是自動化的,以簡化工作。

什麼是全基因組鳥槍測序(whole genome shotgun sequencing)?

全基因組鳥槍測序是一個單步測序過程。在這個過程中,整個基因組首先發生剪切。接下來,這些小片段中的每一個都會隨機進行測序。測序完成後,進行序列分析。在序列分析過程中,重疊的序列被刪除,並且分析不是一個有序的過程。因此,與分層***測序相比,序列組裝是一個效率較低的過程。然而,全基因組鳥槍式測序的過程更為迅速,而且整個基因組的分析可以在單個實例中進行。

等級制(hierarchical)和全基因組鳥槍測序(whole genome shotgun sequencing)的共同點

  • 分層測序和全基因組鳥槍測序是兩種測序方法。
  • 兩種方法都要進行桑格測序或自動桑格測序方法。
  • 它們參與DNA和RN**段的測序。
  • 此外,這兩種方法在分子診斷和研究目的中都很重要。
  • 目前,這兩種技術都是自動化的或基於計算機的。
  • 這兩種技術都依賴於基因組的碎片化。

等級制(hierarchical)和全基因組鳥槍測序(whole genome shotgun sequencing)的區別

與全基因組鳥槍測序相比,分層鳥槍測序產生更大尺寸的片段,後者只處理小片段的序列。所以,這就是分層測序和全基因組鳥槍測序的關鍵區別。此外,分層鳥槍測序包括兩個主要步驟,而全基因組鳥槍測序依賴於一個主要步驟。

此外,分層鳥槍測序和全基因組鳥槍測序的另一個區別是,與分層鳥槍測序相比,全基因組鳥槍測序的分辨率更高。

下面的信息圖總結了分層和全基因組鳥槍測序的區別。

等級制(hierarchical)和全基因組鳥槍測序(whole genome shotgun sequencing)的區別

總結 - 等級制(hierarchical) vs. 全基因組鳥槍測序(whole genome shotgun sequencing)

分層測序和全基因組鳥槍測序是兩種大基因組測序技術。分層鳥槍序列是一個兩步的測序過程,其中基因組被分成更大的片段。相比之下,全基因組鳥槍測序是一個單步測序,其中基因組被分成小片段並直接測序。因此,這就是分層測序和全基因組鳥槍測序的關鍵區別。此外,兩種技術之間的技術方面可能有所不同。

引用

1Waterston,Robert H等。《人類基因組測序》,美國國家科學院院刊,2002年3月19日,可在這裡查閱。夥計,希塔。“基因組測序”,LinkedIn SlideShare,2014年11月4日,可在此處查閱。
2夥計,希塔。“基因組測序”,LinkedIn SlideShare,2014年11月4日,

  • 發表於 2020-10-15 02:27
  • 閱讀 ( 57 )
  • 分類:科學

你可能感興趣的文章

康蒂格(contig)和腳手架(scaffold)的區別

...有間隙,而scaffold是由contigs和gaps組成的。 多細胞生物的基因組測序與單細胞生物的測序相比是非常困難的。全基因組鳥槍測序是一種簡單、快速的多細胞基因組測序技術。這是一種將許多重疊的DN**段並行排列的方法。在這種方...

  • 發佈於 2020-09-15 04:35
  • 閲讀 ( 42 )

結構的(structural)和功能基因組學(functional genomics)的區別

結構基因組學和功能基因組學的關鍵區別在於,結構基因組學是研究基因組的物理性質,包括基因組的測序和作圖,而功能基因組學是研究基因組的表達和功能。 基因組學是生物學的一個領域,它涉及生物體的結構、組織、...

  • 發佈於 2020-09-16 00:27
  • 閲讀 ( 49 )

基因分型(genotyping)和排序(sequencing)的區別

...因的顯性和隱性等位基因。 圖1:RFLP基因分型 什麼是測序(sequencing)? 測序是確定給定DNA或RN**段中核苷酸正確順序的過程。實際上,生物體生長髮育所需的所有資訊都編碼在其基因組中。生產和分離幾百個核苷酸長的核酸片段的...

  • 發佈於 2020-10-07 06:58
  • 閲讀 ( 55 )

逐克隆測序(clone by clone sequencing)和霰彈槍測序(shotgun sequencing)的區別

...因組計劃”中首選的方法。 什麼是鳥槍測序克隆(clone by shotgun sequencing)? 鳥槍克隆測序法是一種將DNA序列隨機分成多個小片段,透過觀察重疊區域來重組序列的測序方法。較大的哺乳動物基因組很難克隆序列和組裝。這是由於...

  • 發佈於 2020-10-12 18:45
  • 閲讀 ( 54 )

基因定位(gene mapping)和基因測序(gene sequencing)的區別

...圖,在那裡識別連鎖基因的位置。 什麼是基因測序(gene sequencing)? 基因測序是用來識別和推斷基因精確鹼基對序列的技術。因此,透過基因測序,我們可以推斷出腺嘌呤、鳥嘌呤、胸腺嘧啶和胞嘧啶鹼基的順序。第一次全基因...

  • 發佈於 2020-10-15 18:59
  • 閲讀 ( 67 )

霰彈槍測序(shotgun sequencing)和下一代測序(next generation sequencing)的區別

shotgun測序與下一代測序的關鍵區別在於,shotgun測序是一種將DNA序列隨機分解成許多小片段並透過觀察重疊區域來重組序列的測序方法,而next next generation sequencement(NGS)則是一種先進的基因測序方法這取決於毛細管電泳。 ...

  • 發佈於 2020-10-16 20:38
  • 閲讀 ( 51 )

全基因組測序(whole genome sequencing)和外顯子組測序(exome sequencing)的區別

...式外顯子組測序 6. 摘要 什麼是全基因組測序(whole genome sequencing)? 人類基因組包含近30億個鹼基對的DNA。全基因組測序是一種對生物體的完整基因組進行測序的方法。因此,在全基因組測序中,考慮的是DNA分子的整體集合,包括...

  • 發佈於 2020-10-17 12:02
  • 閲讀 ( 56 )

引物(pcr primers)和引物測序(sequencing primers)的區別

...過低的溫度將導致DNA聚合酶活性降低。 什麼是引物測序(sequencing primers)? 測序引物用於對DN**段進行測序,目的是揭示其特定的特性。為了獲得良好的測序結果,高質量的引物和模板非常重要。因此,當選擇引物時,它們應該是...

  • 發佈於 2020-10-19 11:47
  • 閲讀 ( 67 )

蛋白質組學(proteomics)和轉錄組學(transcriptomics)的區別

...can also be separated using High-Performance Liquid Chromatography (HPLC). Sequencing of the extracted proteins using methods such as Edmund’s sequencing method or Mass spectrometry. Once the sequences are identified, structural and functional properties of the protein content are ****yzed using c...

  • 發佈於 2020-10-19 18:02
  • 閲讀 ( 57 )

基因測序(gene sequencing)和dna指紋(dna fingerprinting)的區別

...序與DNA指紋圖譜的表格形式 6. 摘要 什麼是基因測序(gene sequencing)? 基因測序是為了確定特定基因的核苷酸序列。如果整個基因組測序被稱為全基因組測序。最初,基因測序是用化學方法進行的,這種方法使用了諸如吡啶等有害...

  • 發佈於 2020-10-20 14:11
  • 閲讀 ( 63 )
qzud3038
qzud3038

0 篇文章

作家榜

  1. admin 0 文章
  2. 孫小欽 0 文章
  3. JVhby0 0 文章
  4. fvpvzrr 0 文章
  5. 0sus8kksc 0 文章
  6. zsfn1903 0 文章
  7. w91395898 0 文章
  8. SuperQueen123 0 文章

相關推薦