分层鸟枪测序和全基因组鸟枪测序的关键区别在于,在分层鸟枪测序中,基因组在测序前被分成较大的片段,而在全基因组鸟枪测序中,整个基因组被分成小片段进行测序。
测序是分子过程中的一项重要技术,特别是在物种的精确鉴定中。事实上,它是一种识别基因或基因组中核苷酸精确顺序的技术。有许多测序技术。其中包括Maxam-Gilbert方法、Sanger方法和自动Sanger方法。
目录
1. 概述和主要区别
2. 什么是分层***排序
3. 什么是全基因组鸟枪测序
4. 分层和全基因组鸟枪测序的相似性
5. 并列比较-以表格形式进行的分层和全基因组鸟枪式测序
6. 摘要
什么是分层***排序(hierarchical shotgun sequencing)?
分层**枪测序是测序的一种方法。它也被称为“自上而下的排序”。此外,该方法包括两个步骤:第一步是基因组扩增,第二步是基因组片段化。在这种方法中,基因组首先被剪切成大片段。然后用载体或人工染色体将这些大片段克隆到不同的宿主中。然后,将这些重组载体排列到一个文库中。在鸟枪测序过程中,重组载体克隆分别进行测序。克隆中的片段经过限制性消化以进一步缩小基因组的大小,从而进行测序。
在分层**枪测序过程中,大块碎片必须在**枪测序之前按顺序排列。它是在克隆过程中结合的分子标记的帮助下发生的。
分层鸟枪测序创造了一个低分辨率的基因图谱。但它创造了一个有序的序列图。因此,它比直接测序需要更长的时间。整个过程由于重组载体库的建立而延迟。它也是一种劳动密集型技术。然而,目前,这项技术是自动化的,以简化工作。
什么是全基因组鸟枪测序(whole genome shotgun sequencing)?
全基因组鸟枪测序是一个单步测序过程。在这个过程中,整个基因组首先发生剪切。接下来,这些小片段中的每一个都会随机进行测序。测序完成后,进行序列分析。在序列分析过程中,重叠的序列被删除,并且分析不是一个有序的过程。因此,与分层***测序相比,序列组装是一个效率较低的过程。然而,全基因组鸟枪式测序的过程更为迅速,而且整个基因组的分析可以在单个实例中进行。
等级制(hierarchical)和全基因组鸟枪测序(whole genome shotgun sequencing)的共同点
- 分层测序和全基因组鸟枪测序是两种测序方法。
- 两种方法都要进行桑格测序或自动桑格测序方法。
- 它们参与DNA和RN**段的测序。
- 此外,这两种方法在分子诊断和研究目的中都很重要。
- 目前,这两种技术都是自动化的或基于计算机的。
- 这两种技术都依赖于基因组的碎片化。
等级制(hierarchical)和全基因组鸟枪测序(whole genome shotgun sequencing)的区别
与全基因组鸟枪测序相比,分层鸟枪测序产生更大尺寸的片段,后者只处理小片段的序列。所以,这就是分层测序和全基因组鸟枪测序的关键区别。此外,分层鸟枪测序包括两个主要步骤,而全基因组鸟枪测序依赖于一个主要步骤。
此外,分层鸟枪测序和全基因组鸟枪测序的另一个区别是,与分层鸟枪测序相比,全基因组鸟枪测序的分辨率更高。
下面的信息图总结了分层和全基因组鸟枪测序的区别。
总结 - 等级制(hierarchical) vs. 全基因组鸟枪测序(whole genome shotgun sequencing)
分层测序和全基因组鸟枪测序是两种大基因组测序技术。分层鸟枪序列是一个两步的测序过程,其中基因组被分成更大的片段。相比之下,全基因组鸟枪测序是一个单步测序,其中基因组被分成小片段并直接测序。因此,这就是分层测序和全基因组鸟枪测序的关键区别。此外,两种技术之间的技术方面可能有所不同。
引用
1Waterston,Robert H等。《人类基因组测序》,美国国家科学院院刊,2002年3月19日,可在这里查阅。伙计,希塔。“基因组测序”,LinkedIn SlideShare,2014年11月4日,可在此处查阅。
2伙计,希塔。“基因组测序”,LinkedIn SlideShare,2014年11月4日,