霰弹枪测序(shotgun sequencing)和下一代测序(next generation sequencing)的区别

shotgun测序与下一代测序的关键区别在于，shotgun测序是一种将DNA序列随机分解成许多小片段并通过观察重叠区域来重组序列的测序方法，而next next generation sequencement（NGS）则是一种先进的基因测序方法这取决于毛细管电泳。

测序是确定一个基因、一组基因、染色体和一个完整基因组中核苷酸精确顺序的过程。基因结构与功能分析和生物鉴定在基因组学、法医学、病毒学、生物系统学、医学诊断、生物技术等诸多领域都具有重要意义。此外，还有不同类型的测序方法可用。鸟枪测序和下一代测序是其中两种先进的测序方法。

什么是**枪测序(shotgun sequencing)？

鸟枪测序是一种通过观察重叠的序列或区域，将整个染色体或整个基因组的DNA序列随机地分解成许多小片段，并通过计算机重新组合序列的方法。一般来说，哺乳动物基因组结构复杂，体积较大。因此，很难通过克隆来对它们进行测序，因为这很耗时。**枪测序是一种更快的方法。这样做也更便宜。因此，现代科学家依靠鸟枪测序方法来解决复杂的基因组问题。

**枪测序(shotgun sequencing)和下一代测序(next generation sequencing)的区别

图01：**枪序列

**枪测序程序相对简单。它首先将整个基因组分成20千碱基到300千碱基不等的大小。然后用链终止法对每个片段进行测序。测序后，有必要使用复杂的计算机软件通过观察重叠区域来组装片段。这种方法不需要常规的序列定位和克隆。此外，该方法没有使用遗传图谱。然而，由于没有使用现有的基因组图，在组装过程中更容易出现错误。这是这种方法的主要缺点之一。此外，在这种方法中，较短的片段为每次读取提供的唯一信息较少。此外，**枪测序无法产生足够的数据，以所需的准确度标准确定一致的序列。

尽管有上述缺点，鸟枪测序法是目前最有效和最具成本效益的微生物基因组测序方法，包括细菌、病毒和酵母。这是因为它们的基因组缺少难以测序的重复区域，而且很容易将这些基因组组装成染色体而不会出错。

什么是下一代测序(next generation sequencing)？

下一代测序（NGS）是一个用来指代现代高通量测序过程的术语。它描述了许多不同的现代测序技术，这些技术革新了基因组研究和分子生物学。这些技术包括Illumina测序、罗氏454测序、离子质子测序和固体（寡连接检测测序）测序。NGS系统更快、更便宜。四种主要的DNA测序方法用于NGS系统：焦测序、合成测序、连接测序和离子半导体测序。大量的DNA或RNA链（数百万）可以被NGS并行测序。它允许在短时间内对生物体的整个基因组进行测序。

图02：下一代测序

NGS有不同的优势。这是一个快速，更准确和成本效益高的过程，可以执行小样本量。因此，它可以在单个测序实验中分析整个人类基因组。此外，NGS可用于宏基因组研究，检测单个基因组中由于**和缺失等原因而产生的变异，以及基因表达的分析。此外，NGS可以同时分析大量组织的整个转录组。因此，NGS彻底改变了转录组的分析。

**枪测序(shotgun sequencing)和下一代测序(next generation sequencing)的共同点

鸟枪测序和下一代测序是两种基因组测序方法。
两种方法都是快速方法。
此外，它们是成本效益高的方法。
他们能够同时对许多DN**段进行测序。

**枪测序(shotgun sequencing)和下一代测序(next generation sequencing)的区别

Shotgun sequencing and next generation sequencing are two advanced sequencing techniques. Shotgun sequencing method randomly breaks DNA sequences of the entire chromosome or entire genome into many **all fragments and reassembles the sequences by computers through observing the overlapping sequences or regi***. In contrast, Next Generation Sequencing (NGS) is a term that refers to modern high throughput sequencing processes. So, this is the key difference between shotgun sequencing and next generation sequencing.

Furthermore, next generation sequencing is a technique that depends on capillary electrophoresis, while shotgun sequencing does not depend. Therefore, this is also a difference between shotgun sequencing and next generation sequencing. Moreover, in comparison to shotgun sequencing, next generation sequencing is highly sensitive and highly accurate

总结 - **枪测序(shotgun sequencing) vs. 下一代测序(next generation sequencing)

鸟枪测序和下一代测序是基因组测序中常用的两种测序方法。这两种方法都是快速且经济有效的方法。NGS的工作原理是通过测序系统快速地同时对数百万个序列进行测序。相比之下，鸟枪测序需要将基因组分成小片段，并使用重叠序列进行测序和重组。因此，本文总结了鸟枪测序和下一代测序的区别。

引用

1《复杂基因组：鸟枪测序》自然新闻，自然出版集团，可在这里获得。Behjati，Sam和Patrick S Tarpey。“什么是下一代测序？儿童疾病档案。教育与实践版，BMJ出版集团，2013年12月，可在此处获取。
2Behjati，Sam和Patrick S Tarpey。“什么是下一代测序？儿童疾病档案。教育实践版，BMJ出版集团，2013年12月，