微阵列(microarray)和rna测序(rna sequencing)的区别

转录组代表存在于细胞中的RNA的全部内容，包括mRNA、rRNA、tRNA、降解RNA和非降解RNA。转录组分析是理解细胞洞察力的一个重要过程。有几种高级的转录组分析方法。微阵列和RNA测序是两种用于分析转录组的技术。微阵列与RNA测序的关键区别在于，微阵列是基于预先设计的标记探针与靶cDNA序列的杂交潜力，而RNA测序是基于通过NGS等先进测序技术对cDNA链的直接测序。微阵列是利用序列的先验知识进行的，而RNA测序是在没有序列先验知识的情况下进行的。

内容1。概述和主要区别2。什么是微阵列3。什么是RNA序列4。并行比较——微阵列与RNA序列5。摘要

什么是微阵列(microarray)？

微阵列是一种稳健、可靠、高通量的转录组分析方法。这是目前最流行的转录分析方法。这是一种低成本的方法，它依赖于杂交探针。

该技术首先从样品中提取mRNA，然后从总RNA中构建cDNA文库。然后将其与荧光标记的预先设计的探针混合在固体表面（斑点矩阵）。互补序列与微阵列中的标记探针杂交。然后对微阵列进行清洗和筛选，并对图像进行量化。对收集到的数据进行分析，得到相对的表达式轮廓。

微阵列探针的强度假定与样本中转录物的数量成比例。然而，该技术的准确性取决于所设计的探针、序列的先验知识以及杂交探针的亲和力。因此微阵列技术有其局限性。微阵列技术不能用于低丰度转录。它不能区分亚型和识别遗传变异。由于这种方法依赖于探针的杂交，因此在微阵列技术中存在一些与杂交有关的问题，如杂交、非特**杂交等。

图01：微阵列

什么是rna测序(rna sequencing)？

RNA鸟枪测序（RNA-seq）是近年来发展起来的一种全转录组测序技术。这是一种快速、高通量的转录组分析方法。它直接量化基因的表达，并导致对转录组的深入研究。RNA序列不依赖于预先设计的探针或序列的先验知识。因此，RNA-seq方法具有较高的灵敏度和检测新基因和遗传变异的能力。

RNA测序法是通过几个步骤来完成的。细胞的总RNA必须分离并破碎。然后，利用逆转录酶制备cDNA文库。每个cDNA链必须与适配器连接。然后连接的片段必须被扩增和纯化。最后使用NGS方法，必须对cDNA进行测序。

图02:RNA测序

微阵列(microarray)和rna测序(rna sequencing)的区别

总结 - 微阵列(microarray) vs. rna测序(rna sequencing)

微阵列和RNA测序方法是为转录组分析开发的高通量平台。这两种方法产生的结果与基因表达谱高度相关。然而，RNA测序在基因表达分析方面比微阵列有优势。RNA测序是一种比微阵列更灵敏的检测低丰度转录物的方法。RNA测序还可以区分异构体和识别基因变体。然而，由于RNA测序是一种新的昂贵的技术，具有数据存储和复杂数据分析的困难，因此微阵列是大多数研究者的共同选择。

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