元基因组学和元转录组学之间的关键区别取决于每个领域研究的生物分子类型。元基因组学研究DNA及其序列及其在生物体中的行为,而metatranscriptomics研究转录的DNA,主要是mRNA序列及其在生物体中的行为。
元基因组学和元转录组学是近年来与微生物群落相关的两个颇受欢迎的领域。它们在卫生保健、工业和农业生物技术中很重要。元基因组学和元转录组学都允许研究一个群落中的个体有机体及其功能作用,无论是有益的还是有害的。
目录
1. 概述和主要区别
2. 什么是元基因组学
3. 什么是转录组学
4. 基因组学与转录组学的相似性
5. 并列比较-表格式的宏基因组学与元转录组学
6. 摘要
什么是宏基因组学(metagenomics)?
元基因组学是探索脱氧核糖核酸(DNA)的研究领域。它与微生物群落关系最密切。而且,与基因组学相比,这是一个更先进的领域。在基因组学中,对特定生物体的DNA进行分析。然而,元基因组学涉及到对整个有机体的遗传物质的分析。因此,这使得研究一个有机体群落与一个条件或一个环境有关的行为成为可能。
元基因组学研究的主要技术是使用微阵列技术的下一代测序技术。NGS方法可以分析单个反应中存在或不存在特定DNA序列的多个生物体。这些DNA序列可能是单一疾病或环境条件的原因。因此,利用亚基因组学知识,可以方便、准确地进行生物筛选。在NGS期间,测序是在短读和分析有机体的DNA发生。16s DNA序列是近年来在微生物亚基因组学研究中的一个热门序列。
在生物群落测序之后,应进行序列比对。使用基本局部对准序列工具(BLAST)等工具来完成对准任务。在排列之后,一个系统发生树提供了群落中每一个有机体之间的关系及其行为的细节。
什么是转录组学(metatranscriptomics)?
元转录组学是研究生物体转录组的一门学科。转录组构成在DNA转录过程中转录的整个RNA序列。转录组中的mRNA序列提供了有关基因表达的信息。元转录组学是对不同群体或群体的多个转录组的分析。
元转录组学研究也使用微阵列技术来寻找短读序列的序列。此外,元转录组学还涉及使用比对工具和树设计方法进行彻底的生物信息学分析。然而,相比元基因组学,元转录组学的研究要困难得多。从整体上提取mRNA或RNA并不像看上去那么容易。由于RNA极易被破坏,并且生存时间很短,因此这些RNA的保存和保存是一个可能的问题。
宏基因组学(metagenomics)和转录组学(metatranscriptomics)的共同点
- 宏基因组学和转录组学是分析生物群落(主要是微生物群落)的高通量技术。
- 这两种技术都使用微阵列技术来推断研究结果。
- 所获得的结果通常使用BLAST比对和系统发育树进行分析。
- 而且,这两种技术都不是针对一个有机体,而是针对一个群体或群落有机体。
- 除此之外,这两个概念的研究大多与微生物有关,主要原因是它们扮演着不同的角色。
宏基因组学(metagenomics)和转录组学(metatranscriptomics)的区别
元基因组学和元转录组学涉及对生物体内遗传物质的分析。因此,元基因组学关注的是DNA的模式和序列,而亚转录组学是指对mRNA或转录的DNA的分析。元基因组学和基因组学之间的关键区别。
此外,提取过程在这两种技术中是不同的;元基因组学涉及DNA提取程序,而转录组学涉及RNA提取程序。因此,这也是元基因组学和元转录组学的一个显著区别。
下面的信息图总结了元基因组学和元转录组学之间的区别:
总结 - 宏基因组学(metagenomics) vs. 转录组学(metatranscriptomics)
元基因组学和元转录组学是一个新的研究领域,它分析一个有机体群落的特定条件。因此,元基因组学是指对DNA序列的分析。相反,转录组学是指对RNA序列或转录的DNA产物的分析。在这方面,转录组学能够识别特定病例的基因表达。两者在分析突变及其影响时都很重要。这些都是早期诊断中使用的快速、可靠的技术。因此,这是元基因组学和元转录组学之间的区别的总结。
引用
1Aguiar Pulido,Vanessa等人。2016年5月12日《代谢组学、微生物组学和代谢组学方法》在线版。