外显子组和转录组的主要区别在于外显子组是基因组中所有蛋白质编码基因外显子的完整序列,而转录组是蛋白质编码基因信使RNA分子的集合。此外,外显子组占整个基因组序列的1-2%,而转录组只占细胞总RNA的不到4%。
外显子组和转录组是基因组中蛋白质编码基因的两个序列集合。两者在基因组研究和疾病诊断中都有不同的应用。
1.什么是外显子组-定义,事实,技术2.什么是转录组-定义,事实,技术3.外显子组和转录组之间的相似性是什么-共同特征概述4.外显子组和转录组之间的差异是什么-关键差异的比较
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外显子组是特定生物体基因组蛋白质编码基因中的外显子集合。基因组的编码序列被**成基因,这些基因既可以编码蛋白质,也可以编码RNA。在原核基因组中,编码序列不被其他序列打断,而在真核基因组中,基因的编码序列被称为内含子的非编码序列打断。因此,**的编码序列被称为外显子。
Figure 1: Ex*** and Intr***
在蛋白质编码基因中,RNA聚合酶在转录过程中将内含子和外显子转录到前体mRNA中。在下面的转录后修饰过程中,合并的内含子被移除。全外显子组测序是外显子组研究的主要技术。WES参与特定基因组片段DNA的杂交,以确定目标DNA序列,然后进行测序。
转录组是在细胞中表达的一组mrna。它只占细胞总RNA的不到4%。由于转录组决定了蛋白质组的组成,它决定了特定细胞的生化能力。另外,一个特定细胞的转录组不能被合成,在细胞分裂过程中,它总是从父细胞到达子细胞。因此,转录,即产生RNA的过程,是维持转录组的步骤。
Figure 2: Transcriptome of Pluripotent Cell
另一方面,尽管每个细胞都包含了产生整个物种转录组的信息,但细胞中的表达基因也取决于环境因素。转录组研究中使用的两种主要技术是微阵列和RNA-seq。
外显子组是指基因组中由外显子组成的部分,外显子编码蛋白质合成的信息,而转录组是指在生物体基因中表达的所有信使RNA分子的总和。因此,从这个定义来看,外显子组和转录组之间的主要区别是不言自明的。
因此,外显子组是蛋白质编码基因中的外显子的集合,而转录组是细胞中表达的mRNAs的集合。
此外,外显子组由DNA组成,而转录组由RNA组成。
外显子组占总基因组的1-2%,而转录组占细胞总RNA的不到4%。
外显子组和转录组的另一个区别是外显子组在基因组水平,而转录组在转录水平。
此外,全外显子组测序是确定外显子组的技术,而微阵列和RNA-seq则确定转录组。
外显子组是由基因组的WES决定的基因组中的一整套外显子。因此,外显子组是一个基于DNA的概念。但是,转录组是一个基于RNA的概念,因为它是细胞的一整套mrna。外显子组和转录组的主要区别在于它们的概念。
1.Warr,Amanda等人,《外显子组测序:当前和未来展望》,G3:基因|基因组|遗传学5.8(2015):1543–1550.PMC。网状物。2018年9月6日。此处提供2。布朗,助教。基因组。第二版。牛津:威利·利斯;第3章,转录组和蛋白质组。此处提供 2.棕色TA。基因组。第二版。牛津:威利·利斯;第3章,转录组和蛋白质组。
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