一項新的鳥類基因分析顯示,火烈鳥和鴿子的親緣關係比外表更為密切。這還不是全部:雞是恐龍的近親,學習新叫聲的鳥類大腦中的基因模式顯示出與人類驚人的相似性。
這些發現源於一個專案,該專案對48種鳥類的基因進行測序,然後用幾個月的超級計算時間來分析它們之間的關係。本週,8篇論文發表在《科學》雜誌上,其中包括來自80個實驗室的200多人。20多篇論文也將在不同的期刊上發表。
耶魯大學的生物多樣性科學家沃爾特·傑茲在一封電子郵件中說:“這是一項令人印象深刻的努力”“這項令人印象深刻的努力為之前的一些缺乏如此廣泛的基因組資訊的斷言提供了重要的支援。”。他沒有參與這個專案。”正如研究表明的那樣,捕獲比傳統方法更多的基因組為解決現有問題提供了更為嚴格的基礎,並提出了新的問題。
在此之前,生物學家依靠其他方法來構建家譜。伊利諾伊大學香檳分校生物工程和電腦科學的奠基人坦迪·沃諾教授說,最早的樹木是由生物學家將長相相似的鳥類分組製成的。隨著基因工具的出現,生物學家們也開始利用它們來創造樹木。
根據個別基因科學家所觀察的情況,家譜發生了變化第一個基於基因的家譜是透過只關註一個基因的進化而形成的。但是研究人員很快發現了一個問題:基因組的不同部分有著不同的進化歷史。根據科學家們對個別基因的觀察,家譜發生了變化。
因此,沃諾和其他研究人員提出了一種新的技術,發表在八篇科學論文中的一篇,叫做統計binning。她的小組使用了常用的方法來建造樹種,並將它們與他們開發的方法進行了比較。他們發現新的方法導致了基因樹的顯著改進,而且它可以在將來用於其他遺傳資料。
一旦這棵樹建立起來,科學家們就發現了其他的東西。杜克大學(Duke University)的神經生物學家、幾篇論文的合著者埃裡希•賈維斯(Erich Jarvis)說,例如,恐龍滅絕後,鳥類的物種出現了爆炸性的多樣化。他說,在大約6000萬年前的那次滅絕事件之後,所有現代鳥類目都是在1000萬到1500萬年的時間內形成的。據一篇科學論文稱,那是在大約1.16億年前鳥類失去牙齒很久之後。
根據發表在BMC Genomics上的一篇論文,雞和火雞似乎比其他鳥類更接近恐龍。雞和火雞似乎比其他鳥類更接近恐龍,經歷了較少的基因組變化。
另一項研究將鳥類與鱷魚、短吻鱷和鱷目動物——即所謂的鱷綱動物——進行了比較,鱷綱動物是經歷過大滅絕時期的恐龍世系的後代。鳥類、鱷魚和恐龍這三種動物被認為是古龍,這是一種至少在2億年前出現的科學分支。到目前為止,科學家們發現鱷魚的進化速度比鳥類慢,而鳥類的進化速度又比哺乳動物慢。
哥本哈根大學遺傳學家湯姆·吉爾伯特在一次記者電話採訪中說:“鳥類也是恐龍的後代。”。他說,這些資料可能有助於科學家推斷出更多關於現在已經滅絕的恐龍物種的資訊。根據《科學》雜誌上發表的一篇論文,今天的鳥類基因資料幫助科學家們開始重建所有古龍的共同祖先。
“鳥類是恐龍的活生生的後代。”除了幫助科學家瞭解遠古,今天的發現對人類也有一些啟示。鳥鳴和人類語言有著共同的基因活動模式,儘管它們是分開進化的。與鳥鳴有關的一個基因FOXP2對我們這些聲樂學習者來說也很重要,因為他們除了帽子和野豬外不喜歡羽毛。與人類相比,新的鳥類基因組使科學家更容易評估鳥類的發聲學習能力。
但根據一篇科學論文,鳥類的發聲學習並不是隻進化一次。它似乎至少出現過兩次,也許是三次——在鳴禽、鸚鵡和蜂鳥身上。在這些鳥的大腦中,大約有55個基因在語言區域不那麼活躍。不學習新噪音的鳥類,如鴿子、鵪鶉和鴿子,它們的基因調控模式不同。人類有。
加拿大西蒙弗雷澤大學研究動物家譜的博士後研究員傑弗裡喬伊(jeffreyjoy)說,隨著基因組測序價格的下降,我們可以期待看到更多類似這樣的研究。他沒有參與今天的研究。據《科學》雜誌的一篇報道,在中國的BGI組織中,對最初的48個基因組進行了測序,還有200個鳥類基因組已經測序,正在等待分析。
“總的來說,這是一個驚人的貢獻,”他在一封電子郵件中說作者提供的資料為研究提供了重要的資源。”
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