非洲国家在独立时面临的最紧迫挑战之一是缺乏基础设施。欧洲帝国主义者以带来文明和发展非洲而自豪，但他们让以前的殖民地几乎没有基础设施。帝国修建了公路和铁路——或者说，他们迫使殖民地臣民修建了公路和铁路——但这些并不是为了建设国家基础设施。帝国公路和铁路几乎总是为了便利原材料的出口。许多人，如乌干达铁路，直奔海岸线。

这些新兴国家还缺乏为原材料增值的制造业基础设施。尽管许多非洲国家拥有丰富的经济作物和矿产资源，但它们自己无法加工这些商品。他们的经济依赖贸易，这使他们很脆弱。他们也被锁定在依赖前欧洲主人的循环中。他们获得了政治上的依赖，而不是经济上的依赖，正如加纳第一任总理和总统夸梅·恩克鲁玛所知，没有经济独立的政治独立是毫无意义的。

能源依赖

基础设施的缺乏也意味着非洲国家的大部分能源依赖于西方经济体。即使是石油资源丰富的国家也没有将原油转化为汽油或取暖油所需的炼油厂。一些领导人，如Kwame Nkrumah，试图通过大规模建筑项目来纠正这一问题，比如沃尔特河水电站大坝项目。大坝确实提供了急需的电力，但它的建设使加纳负债累累。这项工程还需要安置数万加纳人，并导致恩克鲁玛在加纳的支持率直线下降。1966年，恩克鲁玛被推翻。

缺乏经验的领导

独立时，有几位总统，如乔莫·肯雅塔，有几十年的政治经验，但其他总统，如坦桑尼亚的朱利叶斯·尼雷尔，在独立前几年就加入了政治斗争。此外，还明显缺乏训练有素和经验丰富的文职领导。殖民地政府的下层人员长期以来都是非洲人，但上层人员则是白人官员。独立后向国家官员的过渡意味着各级官僚机构中都有一些人以前几乎没有受过培训。在某些情况下，这导致了创新，但非洲国家在独立时面临的许多挑战往往因缺乏经验丰富的领导而更加复杂。

缺乏民族认同感

非洲新国家留下的边界是争夺非洲期间在欧洲划定的边界，而不考虑当地的种族或社会状况。这些殖民地的臣民往往有许多超越其存在感的身份，例如加纳人或刚果人。使一个群体优先于另一个群体或由“部落”分配土地和政治权利的殖民政策加剧了这些分裂。最著名的例子是比利时的政策，它使卢旺达胡图族和图西族之间的分歧具体化，导致1994年的悲惨种族灭绝。

在非殖民化之后，新非洲国家立即同意不可侵犯边界的政策，这意味着它们不会试图重新绘制非洲的政治地图，因为那样会导致混乱。因此，这些国家的领导人面临着一个挑战，即在那些寻求在新国家中占有一席之地的人往往利用个人的地区或种族忠诚的时候，努力打造一种民族认同感。

冷战

最后，非殖民化与冷战同时发生，这给非洲国家带来了另一个挑战。美国和苏维埃社会主义共和国联盟（苏联）之间的推拉使得不结盟即使不是不可能，也是一个困难的选择，而那些试图开辟第三条道路的领导人通常发现他们必须站在一边。

冷战政治也为试图挑战新政府的派系提供了机会。在安哥拉，政府和反叛派系在冷战中得到的国际支持导致了一场持续近三十年的内战。

这些共同的挑战使得非洲难以建立强大的经济或政治稳定，并导致许多（但不是所有！）国家在60年代末到90年代末之间面临的剧变。