尽管太阳能有望成为一种清洁能源，但它的许多缺点阻碍了它的广泛应用。太阳能并不总是像其他形式的电那样可靠，而且安装和维护成本往往很高。大多数专家认为，需要进一步的技术进步，才能使太阳能既方便又实用。然而，一些政府提供补贴以抵消价格，工程师和科学家继续努力改进技术。

经济因素

购买和安装设备的费用是太阳能的主要缺点之一。每一块太阳能电池板的效率都不高，通常只能将10%到18%的太阳能转化为电能。通常需要15到20个配电盘才能产生足够的电力，为一个中等大小的家庭供电；所需数量取决于所需电量、房屋获得的阳光量以及许多其他因素。更大的面板可以产生更多的电力，成本也更高。

除了面板本身的价格外，安装面板的成本因位置、所需面板数量、面板安装位置和其他因素而有很大差异。据大多数估计，在最佳情况下，用发电节省下来的资金偿还初始成本至少需要六年，而在不太理想的情况下，则需要两倍的时间。

可靠性

太阳能的一个缺点是缺乏一致性和可靠性。太阳能设备依靠稳定的阳光供应来发电；太阳一下山，光线就不再照射到太阳能电池板上，功率立即下降。在多云的日子里，用于发电的光线也较少。这意味着需要某种形式的存储技术（通常是电池）或替代能源来确保不间断的电力流动。在没有太阳能的情况下，一些使用太阳能的人仍然连接在电网上接受能量。

太阳和电池板之间的任何障碍物也会减少产生的能量。为了达到最佳效果，太阳能电池板需要放置在不被树木或建筑物遮挡的位置。阳光可以穿透1英寸（2.54厘米）左右的雪来产生能量，但太阳能电池板的工作效率可能不高；冬季任何额外的积雪都可能使它们无法正常工作。

面板损坏

太阳能电池板容易受到元件的损坏，这是太阳能的另一个缺点。紫外线（UV）和其他太阳辐射的持续轰击通常会导致电池板本身退化，就像任何其他长时间暴露在太阳下的材料一样。然而，它们的制造方法有所改进，截至2012年，它们目前的寿命为25至30年。尽管如此，吹灰尘和沙子可能会损坏面板，大冰雹也可能会损坏面板。如果房主不小心，在清除大雪和碎片时也可能造成损坏。

电池和安全问题

由于不可能一天24小时提供太阳能，大多数系统使用一组深循环电池来储存多余的电力，以供夜间和阴天使用。不幸的是，这些电池可能很昂贵，并且比太阳能电池板本身的寿命要短。它们还存在一些安全风险，需要特殊处理，具体取决于所用电池的类型。最便宜、寿命最长的浸没式铅酸蓄电池也需要进行最多的维护和小心处理，因为如果储存不当，它们可能会溢出酸液或爆炸。另外两种最常见的类型，凝胶和吸收式玻璃垫（AGM），危险性较小，但通常更昂贵。

作为电池组的替代方案，一些太阳能发电系统与电网相连。这允许系统在需要时提取电力，并且在许多情况下，当太阳能系统产生的电力超过建筑需要时，将电力送回电网。这种类型的太阳能发电系统的安全相关缺点之一是“孤岛”，当系统继续在电力公司员工可能认为已经死亡的电力线路中发电时，就会发生孤岛现象。这对员工来说是一个触电的风险，尽管许多地区现在要求太阳能发电系统包括一个防孤岛组件，以防止这种情况发生。

解决太阳能的缺点

尽管存在这些不利因素，许多政府、科学家和活动家仍在继续研究如何使太阳能更经济高效。电池技术的进步使得储存太阳能系统产生的电力变得更加容易，而电网连接允许人们将电力出售给电力公司。尽管柔性太阳能电池板的效率通常低于玻璃制成的太阳能电池板，但损坏的可能性较小。许多政府也尽自己的一份力量，通过补贴太阳能电池板的生产和为购买太阳能电池板的个人提供税收优惠来鼓励太阳能的使用。