生物疗法是指利用人体内的各种系统来对抗疾病和其他疾病。例如，免疫疗法实现身体的免疫反应，以对抗癌症等严重疾病。其他例子包括基因治疗和激素治疗。它们都使用天然材料来治疗疾病。

免疫治疗有两种方法。第一种方法使用天然或合成材料来激发免疫反应或增强已经发生的反应。一个常见的例子是使用大多数疫苗。在自然发生的疾病中，如脊髓灰质炎，人体往往没有准备好应对病毒感染细胞的袭击。这导致病毒在一段时间内或永久性地超越人体免疫系统，对个体造成严重损害或死亡。第二种作用是在某些自身免疫性疾病（如狼疮）中停止免疫反应。。

为了在没有这些后果的情况下引发免疫反应，医生能够将病毒的减弱或杀死版本提供给人体。由于病毒的强度不足以造成任何真正的伤害，免疫系统能够通过产生强大的抗体来有效地摧毁它。如果接种了疫苗的人暴露在同样的疾病中，那么身体已经有了几种抗体，可以在引起症状之前将其消灭。这种形式的生物疗法挽救了数百万人的生命。。

激素生物疗法的方法包括使用体内自然存在的激素，尽管治疗过程中使用的一些激素是合成的。例如，在乳腺癌患者中，雄性激素睾酮通常用于缩小或切除任何肿瘤。雌激素激素替代疗法也用于有严重更年期症状的妇女。

基因治疗是生物治疗的另一种形式，提取健康的基因，然后用它来替换体内有缺陷的基因。这通常用于有单基因缺陷的疾病，如镰状细胞贫血。尽管这一过程一直备受争议，但对于某些疾病，基因治疗已经取得了成功。关于基因治疗的有效性和安全性的研究仍在继续，主要是因为在人类身上使用转基因材料可能会产生不想要的结果。。

在一些罕见的情况下，生物疗法也可以指使用活的生物体和动物来治疗疾病。例如，水蛭被用来帮助严重皮肤损伤的患者避免截肢。当皮肤受损死亡时，如严重冻伤或感染时，水蛭可以用来吞噬死亡和患病的皮肤细胞，以便新的皮肤生长。这种生物疗法的其他例子包括利用狗的强烈嗅觉检测癌症，以及利用蜂毒治疗某些神经系统疾病。。