医用消融器是将组织置于极冷或极热温度下的化学品和仪器。当暴露在烧灼或冷冻下时，组织立即死亡，外科医生可以很容易地取出组织。消融手术通常侵入性较小，需要的恢复时间比其他手术短。医生可以在身体的任何部位进行药物消融，从皮肤表面到深层组织。

心脏外科医生使用酒精进行药物消融程序来治疗肥厚型心肌病。被诊断患有这种疾病的患者会经历心脏中隔壁增厚。医生通常在患者清醒但轻度镇静的情况下，在导管实验室进行该操作。在成像技术的指导下，心脏病专家将导管穿入通向心脏的血管。通过导管注入的酒精会接触增厚的管壁，破坏并收缩扩大的组织。。

皮肤科医生使用化学物质进行磨皮和微晶磨皮手术。这种医疗消融术会导致皮肤脱皮。氩气冷冻消融也用于将不需要的生物组织冷冻到零度以下。一旦冷冻，组织就会变硬，专家们会用磨砂刷或金刚石轮一层一层地去除组织。患者可能会因痤疮疤痕、细纹或异常生长而接受表面消融术。

外科医生也使用冷冻消融来摧毁直径达2英寸（5厘米）的内部肿瘤。医生通过一个小切口插入一根中空的魔杖。在计算机断层扫描或超声波的引导下，魔杖到达肿瘤部位并向肿瘤内释放冷冻气体。这些细胞接触后死亡，成为无害的疤痕组织。

医学消融有时包括激光或射频治疗。在手术过程中，除了烧灼血管外，医生还使用激光代替传统的手术刀来烧伤和切割组织。激光也经常用于局部美容手术。射频消融，也称为Cobalation®，使用无线电波和盐水溶液的组合，在两个电极之间形成加热的等离子体场。受到该等离子体场影响的组织立即蒸发。

心脏病学、妇科学和耳鼻喉科是使用受控射频消融术消除异常组织的一些领域。心脏病学家通过阻断心脏不规则的电通路来纠正异常的心律。妇科医生可以使用Cobration®消除子宫肌瘤。耳鼻喉专家通常使用这种方法去除扁桃体和腺样体，或纠正导致睡眠呼吸暂停或打鼾的腭部缺陷。