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I型とII型の制限酵素の主な違いは、I型の制限酵素がII型の制限酵素に比べて非常に複雑であることであり、それ以外に、I型の制限酵素は3つの全く同じサブユニットから構成されている。一方、II型制限酵素は、2つの同じサブユニットからなる単位である。核酸酵素がDNAの内部で切断される酵素を制限酵素と呼ぶ。これらの制限酵素の切断点は、末端ではなくDNAの中間にある。制限酵素のこのような特性のため、それらは内切酵素と呼ばれている。これらの制限は、分子ハサミ、分子ナイフ、分子メス、または制限酵素とも呼ばれる。識別部位または制限部位は、これらの制限酵素がDNAを切断する領域である。この制限点には少なくとも4-8の基地パリがある。そこにはこれらの制限酵素の3つのグループがあり、以下のように示されています。
I型酵素は多サブユニットであり、修飾酵素と制限酵素の複雑な組み合わせである。これらの酵素はランダムな点でDNAを切断するが、それらの識別配列からは遠い。これらの酵素は非常に珍しいと考えられているが、シーケンシングゲノムの分析を経て、よく見られることが分かった。I型制限酵素はゲルバンド型または離散的制限断片を形成しないので、実際の応用ではII型酵素ほど多くないが、それらは確かに特殊な生物化学的意義を持っている。
それらの位置で識別したり、近い位置にしたりします。それ以外に、それらは確かに不連続なゲルストリップと不連続な破片を生じる。それらは高い実用価値を持ち、非常に一般的に使用されています。ビジネスでは随所に見られますこれらの酵素の多くは同型二量体の形でDNAと結合し、対称なDNA配列も識別できる。いくつかの制限酵素はまた、それらがイソダイマーの形で結合するため、非対称DNA配列を識別することができる。一部の酵素は連続配列を識別することもできる。これらのシーケンスでは、識別シーケンスの2つの半部位が隣接している。一部の酵素はまた、不連続な配列を識別し、その半分の部位が互いに分離している。DNA中で発生した分解は片側に5個のリン酸を残し,もう片側に3個のヒドロキシル基を残した。これらは小さく、サブユニットは200~350です。最も一般的なII型酵素はII型である。識別部位の外で片側に割れていますそれらの大きさは正常で、非対称連続シーケンスを識別することができます。2つのドメインがあり、1つはDNAに使用され、もう1つはDNA分解に使用されます。ほとんどの場合、それらは単量体の形でDNAと結合する。DNA鎖には異なる識別部位が含まれており,II型識別酵素はその上で非常に活発である。もう一つのII型酵素はIIG型である。制限酵素と修飾酵素があり、体積が大きい。