主要區別
核酸內切酶和核酸外切酶的主要區別在於，核酸內切酶是從中間切斷核酸鏈的，而核酸外切酶則是從末端切割核酸鏈。
核酸內切酶(endonuclease) vs. 核酸外切酶(exonuclease)
核酸內切酶的作用機理是從中間切斷核酸，而核酸外切酶的作用機理是末端切割核酸。限制性內切酶在酶活性前經歷一個滯後期，而在酶活力前沒有滯後期。核酸內切酶水解後通常形成寡核苷酸鏈，而酶水解後生成單核苷酸或核苷酸。內切酶可以形成粘端或鈍端，但外切酶總是形成粘端。核酸內切酶在阻斷病原體進入中起著重要作用，而在阻斷病原菌進入方面，核酸外切酶並沒有發揮任何重要作用。內切酶的作用不需要3'到5'的自由端；相反，核酸外切酶的作用需要3'到5'的自由端。核酸內切酶通常是特**測序的；另一方面，核酸外切酶通常不是序列特**的。核酸內切酶破壞磷酸二酯鍵，形成限制性片段，但不能逐個消除核苷酸，而核酸外切酶則從核酸的各個末端逐個去除核苷酸。核酸內切酶的各種例項為S1核酸酶、DNA酶和限制性酶，如Hind׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀，DNA聚合酶3′至5′核酸外切酶域。
比較圖
什麼是核酸內切酶(endonuclease)？
核酸內切酶是一類水解酶，通常是指透過分離除兩端以外的核苷酸而在中間切斷多核苷酸鏈的酶。這種內切酶的結果可能導致兩個或更多的核酸片段，一次一個。核酸內切酶可以作用於RNA和DNA。有些核酸內切酶，如脫氧核糖核酸酶（dnase）具有非特**裂解。然而，許多核酸內切酶以一種非常特殊的方式靶向核苷酸序列，這被稱為限制性內切酶，因為它們能夠識別特定的核酸鏈序列。因此，這些限制性內切酶在其作用之前經歷了滯後期。這個特定的核苷酸序列稱為限制性位點。
示例
一些內切酶的例子是S1核酸酶、DNases和限制酶，如Hind，Bam H1和Eco RI。
什麼是核酸外切酶(exonuclease)？
核酸外切酶是一種水解酶，通常是指一次消除一個核苷酸而在鏈末端切斷多核苷酸鏈的酶。在真核生物和原核生物中可發現3種類型的核酸外切酶，即3'至5'核酸外切酶、5'至3'外切酶和聚（A）特**3'至5'核酸外切酶。這三種類型都在mRNA轉換中起作用。在大腸桿菌中，有17種不同型別的核酸外切酶，包括DNA聚合酶1、2和3。核酸外切酶在基因重組、基因組穩定、DNA修復、防止突變等方面具有重要作用。
示例
外核酸酶的各種例子有：脾臟磷酸二酯酶、蛇毒、DNA聚合酶3'至5'外核酸酶區、5'至3'外核酸酶活性、3'至5'DNA聚合酶外核酸酶域。
主要區別
- 核酸內切酶在核酸之間形成缺口，而核酸外切酶在核酸末端形成缺口。
- 限制性內切酶在內切酶作用前經歷一個滯後期，而在外切酶運動前沒有滯後期。
- 核酸內切酶水解後通常形成寡核苷酸鏈，而酶水解後生成單核苷酸或核苷酸。
- 核酸內切酶可以在鏈上形成粘端或鈍端，但外切酶總是形成粘端。
- 核酸內切酶在阻斷病原體和其他化學物質的進入方面起著重要作用；另一方面，核酸外切酶並不阻止病原體的進入。
- 內切酶的作用不需要3'到5'的自由端；相反，核酸外切酶的作用需要3'到5'的自由端。
- 核酸內切酶通常是特**測序的；另一方面，核酸外切酶通常不是序列特**的。
- 核酸內切酶破壞磷酸二酯鍵並形成限制性片段，但它們不能一次消除一個核苷酸，而核酸外切酶則從核酸的各個末端逐個去除核苷酸。
- 核酸內切酶的各種例項為S1核酸酶、DNA酶和限制性酶，如Hind׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀׀，DNA聚合酶3′至5′核酸外切酶域。
結論
以上討論得出結論：核酸內切酶從中間切斷核酸鏈，在其作用前經歷一個滯後期，而外切酶從末端切斷核酸鏈，不經歷滯後期。
