扎根的(rooted)和无根系统发育树(unrooted phylogenetic tree)的区别

系统发育学是探索地球生命的一个重要领域。它揭示了有机体与其祖先和后代之间的联系。生物之间的关系以图解的方式表示，如登度图、分支图、物候图、系统图等。系统发育树是一种分枝树状图，它用进化距离来解释生物之间的系统发育关系。有两种主要类型的系统发生树被称为有根和无根。有根系统发育树与无根系统发育树的主要区别在于，有根树显示的是树的最基本的祖先，而无根的系统发生树不显示祖先的根。

内容1。概述和主要区别2。什么是有根的系统发育树3。什么是无根系统发生树4。并排比较树状进化与非树状进化。摘要

什么是有根的系统发育树(a rooted phylogenetic tree)？

一个有根的系统发生树是一个有用的图表，显示进化历史。它有一个称为根的基本节点，代表所有树组的共同祖先。树的根被认为是树中最老的点，它代表树中所有组的最后一个共同祖先。因此，有根的树显示了进化时间的方向。从一棵有根树的单个物种中，可以通过追溯到基部节点来找到共同的祖先或物种的祖先。因为有根的树描绘了进化时间的方向，所以很容易找到它所拥有的较老或较新的群体。有根的树可以用来研究整个生物群。系统发育树的准确生根是一个重要和关键的因素，因为不准确的生根会导致对生物体之间的遗传变化及其进化方向的错误解释。

图01：有根的系统发育树

什么是无根系统发生树(an unrooted phylogenetic tree)？

无根系统发生树是一种缺乏共同祖先或基本节点的系统发育图。这种类型的树并不表示兴趣群体进化的起源。它只描述了生物之间的关系，而不考虑进化时间线的方向。因此，很难用无根树来研究种群与时间的演化关系。

有两种主要的方法来建立一个无根的系统发生树。他们是

• 找到一个外群-这需要预先了解分类群之间的关系。然后，一个位于类群之外的分类单元可以作为外类群来绘制有根的系统发育树

• 找到中点或距离-树中最远的两个分类群的中点可以假设为系统发育树的根。

图02：无根系统发生树

扎根的(rooted)和无根系统发育树(unrooted phylogenetic tree)的区别

总结 - 扎根的(rooted) vs. 无根系统发育树(unrooted phylogenetic tree)

系统进化树用树枝状的树状图表示生物之间的进化路径和联系。系统发育树可以有根也可以无根。根树的底部有一个节点，表示连接所有兴趣组的共同祖先。一棵没有树冠的树显示了有机体之间的关系。然而，它并没有描述所有群体共享的共同祖先。这就是有根和无根的系统发生树的区别。