这个“手提箱里的实验室”去年帮助追踪埃博拉病例

最近的埃博拉疫情将世界各地的医生和科学家带到西非,救援组织和政府正迅速阻止埃博拉的致命传播。现在,大量的资源正在产生一种技术,其影响可能远远超出埃博拉病毒。今天发表在《自然》杂志上的一篇论文详细介绍了一种新的现场基因样本分析系统,这一工具去年为追踪埃博拉病毒提供了关键数据,在追踪未来的疫情方面可能会更加强大。...

最近的埃博拉疫情将世界各地的医生和科学家带到西非,救援组织和**正迅速阻止埃博拉的致命传播。现在,大量的资源正在产生一种技术,其影响可能远远超出埃博拉病毒。今天发表在《自然》杂志上的一篇论文详细介绍了一种新的现场基因样本分析系统,这一工具去年为追踪埃博拉病毒提供了关键数据,在追踪未来的疫情方面可能会更加强大。

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这些仪器装在三个航空公司准备好的袋子里,总重量不到50公斤,科学家可以把它们带到疫情前线的偏远诊所。在2015年3月至10月期间,研究小组收集了142个不同的埃博拉病毒样本,通常在两个工作日内返回结果,如果研究人员努力解决断电或连接问题,结果会延迟更长时间。这些样本提供了有关疾病如何在几内亚和塞拉利昂边界传播的宝贵信息。


这个“手提箱里的实验室”去年帮助追踪埃博拉病例

Tommy Trenchard/欧洲移动实验室

新系统解决了公共卫生领域的一个核心问题:如何在病毒传播时追踪病毒。通常情况下,科学家通过寻找病毒基因组中的突变,对病毒的个别实例进行基因扫描,以了解不同病例之间的相互关系,来跟踪这一变化。这项技术对研究最近的埃博拉马科纳毒株特别有效,该毒株的每个基因组都有16到27个突变。但这项工作传统上需要一个完整的实验室设置,而在埃博拉病毒追踪最为迫切的地区,这是不可用的,因此科学家们不得不临时凑合,建立一个所谓的“手提箱实验室”

安大略省癌症研究所的贾里德·辛普森是这篇论文的102位独立合著者之一,他说:“这使基因组研究在世界范围内有了更多的应用。”我们期待着在这项研究所做工作的基础上再接再厉,并将其应用于包括癌症研究在内的其他领域。”

手掌大小的基因组分析仪

安装的关键是MinION MkI,一个手掌大小的基因组分析仪,通过USB连接到传统笔记本电脑。这种装置的错误率比传统的测序仪高得多,但研究人员能够通过多次运行每个样本来减轻错误。结果不如传统实验室设备的数据全面,但足够精确,可以追踪疾病的传播。”这篇论文的另一位合著者、伯明翰大学的尼古拉斯·洛曼(nicholasloman)说:“这种超便携测序装置只有在仆从的情况下才有可能实现。”在过去的五年里,测序器已经变得越来越小,但是它们仍然非常昂贵和笨重。”

现在便携式基因组测序设备还处于起步阶段,洛曼和其他人期待着未来的系统能够完全离线运行。不过,一旦钻井平台足够小、足够独立,它就可以提供一种新的方法,甚至可以追踪非传染性疾病。”洛曼说:“目前还不清楚埃博拉病毒在两次爆发之间究竟在哪里以及在哪些动物中持续存在。”建立这个系统的方便意味着你有可能在全球建立基因组监测站。”

  • 发表于 2021-05-03 07:44
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  • 分类:互联网

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