宗教在叙利亚持续冲突中扮演着次要但重要的角色。2012年末发布的一份联合国报告称，叙利亚部分地区的冲突正变得“明显的宗派主义”，叙利亚各宗教团体发现自己站在总统巴沙尔·阿萨德政府和叙利亚分裂的反对派之间斗争的对立面。

日益扩大的宗教分歧

叙利亚内战的核心不是宗教冲突。分界线是对阿萨德政府的忠诚。然而，一些宗教团体往往比其他团体更支持该政权，在该国许多地区助长了相互猜疑和宗教不容忍。

叙利亚是一个阿拉伯国家，库尔德人和亚美尼亚人占少数。就宗教身份而言，大多数阿拉伯民族属于伊斯兰教的逊尼派分支，几个穆斯林少数群体与什叶派伊斯兰教有联系。来自不同教派的基督教徒在人口中所占比例较小。

反政府叛乱分子中出现了强硬的逊尼派伊斯兰民兵，他们为建立伊斯兰国而战斗，这使少数民族疏远了。来自什叶派伊朗的外部干扰，伊斯兰国家武装分子试图把叙利亚作为他们广泛的哈里发和逊尼派沙特阿拉伯的一部分，使事情变得更糟，从而加剧了中东逊尼派什叶派紧张局势。

阿拉维派

阿萨德总统属于阿拉维派少数派，是什叶派伊斯兰教的一个分支，叙利亚特有（黎巴嫩人口稀少）。巴沙尔·阿萨德家族自1970年以来一直掌权（巴沙尔·阿萨德的父亲哈菲兹·阿萨德从1971年起担任总统，直到2000年去世），尽管阿萨德家族领导着一个世俗政权，但许多叙利亚人认为阿拉维派享有获得政府高层职位和商业机会的特权。

2011年反政府起义爆发后，绝大多数阿拉维派人士支持阿萨德政权，担心逊尼派多数上台后会受到歧视。阿萨德军队和情报部门的大多数高层都是阿拉维派，这使得阿拉维派社区作为一个整体与内战中的政府阵营有着密切的联系。然而，一群阿拉维派宗教领袖最近宣布脱离阿萨德独立，他们质疑阿拉维派社区本身是否在支持阿萨德方面分裂。

逊尼派穆斯林阿拉伯人

大多数叙利亚人是逊尼派阿拉伯人，但他们在政治上存在分歧。的确，在自由叙利亚军队伞下的反对派武装组织中的大多数战士来自逊尼派省份的中心地带，许多逊尼派伊斯兰教徒不认为阿拉维派是真正的穆斯林。主要是逊尼派叛军和阿拉维派领导的政府军之间的武装冲突一度导致一些观察家将叙利亚内战视为逊尼派和阿拉维派之间的冲突。

但是，事情并不是那么简单。大多数与叛军作战的正规政府士兵都是逊尼派新兵（尽管数千人叛逃到不同的反对派团体），逊尼派在政府、官僚机构、执政的复兴社会党和商界中占据领导地位。

一些商人和中产阶级逊尼派支持该政权，因为他们想保护自己的物质利益。其他许多人只是被反叛运动中的伊斯兰组织吓坏了，不信任反对派。无论如何，逊尼派群体的支持是阿萨德生存的关键。

基督教徒

叙利亚的阿拉伯基督教少数派曾在阿萨德统治下享有相对安全，并被该政权的世俗民族主义意识形态所融合。许多基督教徒担心这一政治压迫但宗教宽容的独裁政权将被歧视少数民族的逊尼派伊斯兰政权所取代，并指出萨达姆·侯赛因倒台后伊斯兰极端分子将起诉伊拉克基督教徒。

这导致了基督教建制：商人、高级官僚和宗教领袖支持政府，或至少与2011年他们所认为的逊尼派起义保持距离。尽管叙利亚全国联盟等政治反对派中有许多基督徒，在支持民主的青年活动家中，一些反叛组织现在认为所有基督徒都是与该政权的合作者。与此同时，基督教领导人现在面临着道德义务，要公开反对阿萨德针对所有叙利亚公民的极端暴力和暴行，而不管他们的信仰如何。

德鲁兹人和伊斯梅尔人

德鲁兹人和伊斯梅尔人是两个截然不同的穆斯林少数民族，据信是从伊斯兰教的什叶派分支发展而来的。与其他少数民族不同，德鲁兹人和伊斯梅尔人担心该政权的潜在垮台将让位于混乱和宗教迫害。他们的领导人不愿加入反对派常常被解释为默许支持阿萨德，但事实并非如此。这些少数民族夹在伊斯兰国、阿萨德军队和反对派等极端组织之间，智库IRIS的一位中东分析人士卡里姆·比塔尔（Karim Bitar）称之为宗教少数群体的“悲惨困境”。

十二什叶派

虽然伊拉克、伊朗和黎巴嫩的大多数什叶派都属于主流的十二派，但这一主要形式的什叶派伊斯兰教在叙利亚只是极少数，集中在首都大马士革的部分地区。然而，2003年后，随着逊尼派-什叶派内战期间数十万伊拉克难民的到来，他们的人数激增。十二个什叶派害怕激进的伊斯兰主义者接管叙利亚，并在很大程度上支持阿萨德政权。

随着叙利亚不断陷入冲突，一些什叶派返回伊拉克。其他人组织民兵保护他们的社区免受逊尼派叛军的袭击，这又为叙利亚宗教社会的分裂增加了一层。