天然氣(ngs)和雙脫氧測序法(sanger sequencing)的區別
下一代測序(NGS)和Sanger測序是隨時間發展起來的兩種核苷酸測序技術。Sanger測序法被廣泛應用多年,由於其優越性,近年來被NGS取代。NGS和Sanger測序的關鍵區別在於NGS的工作原理是通過測序系統以快速的方式同時對數百萬個序列進行測序,而Sanger測序的原理是由於DNA聚合酶在DNA過程中選擇性地加入了雙脫氧核苷酸複製和毛細管電泳分離片段。
內容1。概述和主要區別2。什麼是核苷酸序列3。什麼是NGS4。什麼是測序。並列比較——NGS與Sanger測序6。摘要
什麼是核苷酸測序(nucleotide sequencing)?
遺傳信息儲存在生物體的DNA或RNA的核苷酸序列中。在一個給定的片段(在一個基因、一組基因、染色體和整個基因組中)確定核苷酸的正確順序(使用四個鹼基)的過程被稱為核苷酸測序。基因的結構和功能分析在基因組學、法醫學、病毒學、生物系統學、醫學診斷、生物技術等許多領域都具有重要意義。科學家們開發了不同類型的測序方法。其中,由Frederick Sanger於1977年開發的Sanger測序被廣泛應用和推廣了很長一段時間,直到下一代測序取代了它。
什麼是天然氣(ngs)?
下一代測序(NGS)是一個用來指代現代高通量測序過程的術語。它描述了許多不同的現代測序技術,這些技術革新了基因組研究和分子生物學。這些技術包括Illumina測序、羅氏454測序、離子質子測序和固體(寡連接檢測測序)測序。NGS系統更快、更便宜。四種主要的DNA測序方法用於NGS系統,即焦測序、合成測序、連接測序和離子半導體測序。大量的DNA或RNA鏈(數百萬條)可以並行測序。它允許在短時間內對生物體的整個基因組進行測序,不像桑格測序需要更多的時間。
NGS方法比傳統的測序Sanger法有許多優點。它是一種快速、更準確、經濟有效的過程,可以在小樣本量下進行。NGS可用於亞基因組研究,檢測個體基因組內因**和缺失等原因而產生的變異,以及分析基因表達。
什麼是雙脫氧測序法(sanger sequencing)?
Sanger測序是由Frederick Sanger和他的同事在1977年開發的一種測序方法,用於確定給定DN**段的精確核苷酸順序。它也被稱為鏈終止測序或雙脫氧測序。ddeotp是dd-tp在DNA合成過程中選擇性終止DNA鏈的方法。正常核苷酸有3’OH基團,用於在相鄰核苷酸之間形成磷酸二酯鍵,以繼續鏈的形成。然而,ddNTPs缺乏這個3'OH基團,不能在核苷酸之間形成磷酸二酯鍵。因此,鏈伸長停止。
在這種方法中,待測序的單鏈DNA作為體外DNA合成的模板鏈。其他要求是寡核苷酸引物,脫氧核苷酸前體和DNA聚合酶酶。當目標片段的側翼末端已知時,可以很容易地設計引物進行DNA複製。四個不同的DNA合成反應在四個不同的試管中進行。每根管子都有單獨的DDNTP和其他要求。從特定的核苷酸中加入dNTPs和ddNTPs的混合物。同樣地,在四個管中用四種混合物進行四種不同的反應。反應完成後,進行DN**段的檢測和序列信息的轉換。產生的DN**段經過熱變性並通過凝膠電泳分離。如果使用放射性核苷酸,聚丙烯酰胺凝膠中的帶型可以通過放射自顯影來觀察。當這種方法使用熒光標記的脫氧核苷酸時,它可以減輕凝膠讀數並通過激光束被熒光檢測器檢測。為了避免當一個序列被肉眼讀取並手動輸入計算機時可能出現的錯誤,這種方法發展成與計算機耦合的自動測序器的使用。
這是一種從人類基因組計劃中提取DNA序列的方法。這種方法在先進的改進中仍在使用,因為它提供了精確的序列信息,儘管這是一個昂貴和緩慢的過程。
天然氣(ngs)和雙脫氧測序法(sanger sequencing)的區別
NGS與Sanger測序 | |
下一代測序(NGS)是指現代高通量測序過程。現代測序技術描述了許多不同的技術 | Sanger測序是由Frederick Sanger開發的一種測序方法,用於確定給定DN**段的精確核苷酸順序。 |
成本效益 | |
NGS是一種更便宜的工藝,因為它減少了時間、人力和化學物質。 | 這是一個昂貴的過程,因為它需要時間,人力和更多的化學品。 |
速度 | |
這是更快的,因為化學檢測和信號檢測的許多股同時發生。 | 這是非常耗時的,因為化學檢測和信號檢測作為兩個獨立的過程進行,並且一次只能在鏈上讀取。 |
可靠性 | |
NGS是可靠的。 | 桑格測序不太可靠 |
樣本量 | |
NGS需要更少的DNA。 | 這種方法需要大量的模板DNA。 |
每個測序片段的DNA鹼基 | |
每個測序片段的DNA鹼基數低於Sanger法 | 生成序列比NGS序列長。 |
總結 - 天然氣(ngs) vs. 雙脫氧測序法(sanger sequencing)
NGS和Sanger測序是廣泛應用於分子生物學的核苷酸測序技術。Sanger測序是一種早期測序方法,被NGS取代。NGS和Sanger測序的主要區別在於NGS是一種比Sanger測序更快速、更精確和更具成本效益的過程。這兩種技術在遺傳學和生物技術領域引起了重大的爆發。
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