一项新的DNA分析显示，16世纪墨西哥一种神秘的流行病可能与一种罕见的沙门氏菌有关，这种流行病夺走了数百万人的生命。这一发现是迄今为止关于一种毁灭性传染病起因的最好线索，这种传染病在1545年至1550年间夺去了墨西哥80%的土著人口的生命，这种传染病蔓延到了危地马拉，甚至可能蔓延到南部的秘鲁。

当时，没有人见过这种疾病：它使受害者脸上流血。这一时期的医学文献显示，成堆的尸体和身上布满皮疹的人，鼻子里涌出鲜血。土著民族称之为“休伊·科科科利兹特里”，或大瘟疫。西班牙侵略者将其命名为“pujamiento de sangre”，意思是大量流血或全血。现在，在分析了人类遗骸中的DNA后，一个科学家小组有了一个新的名字：一种罕见的肠道沙门氏菌菌株，称为副伤寒C，该小组今天在《自然生态学》杂志上报道；进化

副伤寒C的症状是通过被人类粪便污染的食物和水传播的，与历史上关于发热、皮疹、胃痛和肠出血的报告相符。研究人员无法确定这种微生物是否导致了毁灭性的流行病。但在16世纪中期墨西哥墓地出土的24具尸体中，有10具被检测为细菌阳性，这很可能是个嫌疑——特别是因为当时的大面积干旱可能会损害卫生设施。

德国马克斯·普朗克人类历史科学研究所的考古遗传学家、该研究的主要作者åshild Vågene说：“我们都很高兴能够找到一些东西，因为很多时候DNA根本无法保存。”对我们来说，24分之10真的很酷。”

这座公墓是由墨西哥国家人类学和历史研究所考古学国家协调员内莉·罗伯斯·加西亚（Nelly Robles Garcia）领导的挖掘中发现的两处墓地之一。其中一个墓地比较古老，欧洲人在新大陆登陆之前人们就在这里安葬。另一次是15世纪中期，大约是欧洲人首次进入该地区的时候。两者都位于一个叫Teposcolula Yucundaa的地点，该地点位于墨西哥南部的山脊上。西班牙人曾是当地Mixteca人的家园，1545-1550年疫情爆发后，西班牙人迫使该地区的剩余人口迁移。

马克斯-普朗克研究所的科学家们在哈佛大学的研究人员调查了从前接触墓地挖掘出的五具尸体的遗骸，以及在后接触墓地埋葬的24具尸体。研究人员敲开牙齿，从牙釉质保护了几个世纪的富含血管的肉质组织中提取DNA。当谈到寻找脆弱、古老的DNA时，Vågene说，“我们真的认为这是我们找到任何东西的最佳选择。”

在对困在牙齿内的人类和微生物DNA汤进行测序后，研究人员必须找出哪些遗传密码串来自哪些生物。因此，他们使用了一种算法，将每一段代码与已知的微生物基因组进行比对——搜索匹配项。三颗牙齿上的DN**段与沙门氏菌基因组完全吻合。在数据库中的沙门氏菌菌株中，副伤寒C是最匹配的。

一旦小组知道他们在寻找什么，就更容易发现副伤寒C DNA的痕迹。他们在10名埋在接触后墓地的人身上发现了这种病毒，但在接触前墓地或现场的土壤样本中没有发现这种病毒（一个可能被污染的土壤样本除外）。这意味着这些细菌可能不是墨西哥南部的本地细菌，而且可能来自欧洲。根据印前服务器bioRxiv上发布的一项尚未经过同行审查的研究，有迹象表明副伤寒C早在公元1200年就在欧洲。

麦克马斯特大学的一位古DNA专家Hendrik Poinar没有参与这项研究，他说，研究小组将C型副伤寒与这一流行病联系起来。当时肯定还有其他传播疾病可能以类似的方式导致人们死亡——单独或与副伤寒C合作。”“总是很难排除其他因素，”波纳尔在给《边缘》的一封电子邮件中说。其他微生物可能保存不好，或者血液中的微生物含量不足以被检测到。尽管如此，他说，“我认为这篇论**得很好！”

Vågene同意还有更多的工作要做，包括调查墨西哥和中美洲的其他地点是否有副伤寒C的痕迹。”“我们还没有解决它，”她说我要说的是，我们为这个难题增加了一块。”