什么是基因组浏览器？(a genome browser?)
基因组浏览器是用于查看染色体物理图的web界面。这张地图显示了以碱基对测量的两个基因之间的DNA分离程度。人类染色体的大小从5000万到2.5亿碱基对不等。基因组浏览器显示整个染色体的示意图，以及单个基因甚至实际碱基对序列的“放大”示意图。
基因组浏览器允许用户滚动染色体并放大某些位置。许多基因组浏览器允许用户在查看实际DNA序列的水平上放大，尽管浏览器的真正用途在于能够在更大的背景下查看基因，而不是在核苷酸水平上查看DNA序列。一个基因的平均大小是3000个碱基对，因此当放大碱基对级别时，用户将看到少于整个基因。人类最大的基因dystrophin有240万碱基对长。。
除了查看基因的示意图外，基因组浏览器还可以显示其他有用的信息。这可能包括翻译成蛋白质的基因部分，称为mRNA，以及具有蛋白质编码以外功能的DNA序列。基因组浏览器还可以显示基因组测序过程中使用的DNA片段。
许多生物都已对基因组进行了测序。基因组学领域没有标准的单一浏览器，因此基因组浏览器可能会因测序基因组而异。基因组浏览器的功能是能够搜索感兴趣的基因或序列，允许用户从一个基因组位置跳到另一个基因组位置。因为大多数染色体的大小都非常大，所以滚动一条染色体以到达感兴趣的位置是不有效的。
一些基因组浏览器有一种叫做基因排序器的工具。此工具显示一个相互关联的基因表。这种关系可以是几种类型之一：序列同源性、相似的表达谱或基因组接近性。用户使用单词或短语搜索基因，选择他或她想要的关系类型，基因分类器显示搜索结果。
- 发表于 2022-01-08 20:49
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- 分类：健康医疗
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