桑格(sanger)和下一代测序(next generation sequencing)的区别

Sanger测序和下一代测序的主要区别在于,Sanger测序一次只处理一个DNA片段,而下一代测序一次同时处理数百万个片段。此外,Sanger测序是类似的,而下一代测序是数字的,允许通过深度测序检测新的或罕见的变异。此外,Sanger测序是一种快速且成本效益高的方法,用于低数量的靶点,一般可达20个靶点,而下一代测序是一种耗时且成本效益较低的方法。...

Sanger测序和下一代测序的主要区别在于,Sanger测序一次只处理一个DN**段,而下一代测序一次同时处理数百万个片段。此外,Sanger测序是类似的,而下一代测序是数字的,允许通过深度测序检测新的或罕见的变异。此外,Sanger测序是一种快速且成本效益高的方法,用于低数量的靶点,一般可达20个靶点,而下一代测序是一种耗时且成本效益较低的方法。

Sanger测序和下一代测序是DN**段测序的两种方法。此外,选择Sanger或下一代测序取决于这两种方法的优点和局限性。

覆盖的关键领域

1.什么是Sanger测序-定义、过程、重要性2。什么是下一代测序-定义、过程、重要性3。Sanger和下一代测序之间有什么相似之处——共同特征概述4。Sanger和下一代测序的区别是什么?关键区别的比较

关键术语

下一代测序(NGS),并行测序,Sanger测序(SGS),测序,测序深度

桑格(sanger)和下一代测序(next generation sequencing)的区别

什么是双脱氧测序法(sanger sequencing)?

Sanger测序(SGS)是fredricsanger于1977年开发的第一代测序方法,它涉及DNA聚合酶在体外DNA复制过程中选择性地掺入链终止的双脱氧核苷酸。然后,用毛细管电泳分离产生的扩增子。一般来说,Sanger测序是一种快速和经济有效的测序方法,适用于小于100个扩增目标的小规模项目。此外,它更适合于单基因测序。

Sanger vs Next Generation Sequencing

Figure 1: Sanger Sequencing

此外,Sanger测序是一种类似的方法,它通过组合样本中所有DN**段的信号来生成单个序列。它不允许隔离单个信号。因此,产生的信号是混合信号,不允许识别样本中频率低于25%的变体。

什么是下一代测序(next generation sequencing)?

下一代测序(NGS)是第二代测序方法。此外,它是一种高通量DNA测序方法,具有大规模并行处理的概念。基因组分析仪/HiSeq/MiSeq(Illumina Solexa)、固体系统(Thermo Fisher Scientific)、离子PGM/离子质子(Thermo Fisher Scientific)和HeliScope Sequencer(Helicos BioSciences)是目前执行下一代测序的几个平台。一般来说,他们可以顺序100万至430亿短期读取(50-400基地每个)每个仪器运行。

What is the Difference Between Sanger and Next Generation Sequencing

Figure 2: Clonal Amplification in Illumina Sequencing

此外,下一代测序的主要特点是可以对多个目标进行并行研究。它提高了突变检测的速度和效率。一般来说,在体细胞癌突变中,肿瘤是异质性的,既包含癌细胞,也包含正常细胞。然而,在平行测序的下一代测序中通过克隆扩增制备DNA文库有助于从物理上分离来自文库中每个靶DNA分子的信号。因此,这使得癌细胞的DNA序列可以从正常细胞的DNA序列中分离出来。总的来说,下一代测序是一种覆盖深度更高的数字测序方法。

sanger与下一代测序的相似性

  • Sanger法和下一代测序法是测定DN**段核苷酸序列的两种主要方法。
  • 他们的技术是相似的,包括通过DNA聚合酶将荧光核苷酸添加到生长的模板链上。
  • 此外,添加的核苷酸的鉴定是通过它们的荧光标记。
  • 而且,两者都是自动化技术。

桑格(sanger)和下一代测序(next generation sequencing)的区别

定义

Sanger测序是指用于确定个体基因组的一部分核苷酸序列的高通量方法,而下一代测序是指用于确定个体基因组的一部分核苷酸序列的高通量方法。因此,这是Sanger和下一代测序的主要区别。

其他姓名

Sanger测序的其他名称是双脱氧链终止法或毛细管电泳测序,而下一代测序的其他名称是大规模平行测序或大规模平行测序。

一代

Sanger测序是第一代测序方法,而下一代测序是第二代测序方法。

商业化

此外,Sanger测序首先由Applied Biosystems商业化,而下一代测序平台的主导者是Illumina。

dna片段大小

Sanger测序和下一代测序的另一个区别是,虽然Sanger测序对750-1000个碱基对片段效果更好,但下一代测序对大约2000万个碱基对的长片段效果更好。

一次采样数

此外,Sanger测序一次只能处理一个DN**段,而下一代测序一次可以同时处理数百万个片段。

覆盖深度

重要的是,Sanger测序是类似的,因为它将所有DN**段组合在一个混合物中,产生一个单一的序列,而下一代测序是数字化的,因为它允许分离混合物中单个分子的每个单独数据。

敏感

另外,敏感性是Sanger和下一代测序的另一个区别。Sanger测序法灵敏度较低,检测限在15-20%左右,而下一代测序法灵敏度较高,检测限在1%以下。

低样本数成本

除此之外,Sanger测序在20个样本中快速且成本效益高,而下一代测序在20个样本中耗时且成本效益较低。

每高样本数的成本

Sanger测序对于样本数量较多的情况成本效益较低,而下一代测序对于样本数量较多的情况成本效益较高。

临床研究排序

Sanger测序和下一代测序的另一个区别是,Sanger测序是临床研究测序的“金标准”,而下一代测序在临床实验室中越来越普遍。

应用

此外,Sanger测序在片段分析、微生物鉴定、STR分析、NGS确认等方面具有重要意义,而下一代测序在病原微生物基因组、转录组分析、突变检测等基因组测序方面具有重要意义。

结论

Sanger测序是第一代测序方法,它涉及到用荧光标记的双脱氧核苷酸扩增目标DN**段并通过毛细管电泳进行分析。一般来说,这种方法是快速和成本效益为少数样本。由于是类比法,灵敏度较低。另一方面,下一代测序是第二代测序方法,与Sanger测序技术相似。这是一种大规模并行测序方法,一次处理数百万个样本。此外,下一代测序的主要特点是测序深度,它允许检测变异。因此,Sanger和下一代测序的主要区别在于样本处理的数量和测序的深度。

引用

Arsens,Ruza et al.“靶向下一代测序和Sanger测序检测乳腺癌中PIK3CA突变的比较。” BMC临床病理学 第15卷2015年11月18日,doi:10.1186/s12907-015-0020-6

  • 发表于 2021-07-02 00:33
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  • 分类:科学

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