一致性pcr(consensus pcr)和泛聚合酶鏈反應(pan pcr)的區別

一致PCR與pan PCR的關鍵區別在於,一致PCR總是以保護區為目標,而pan PCR則以可變區域為目標,以確定一組不同菌株...

一致PCR與pan PCR的關鍵區別在於,一致PCR總是以保護區為目標,而pan PCR則以可變區域為目標,以確定一組不同菌株

聚合酶鏈反應(PCR)是一種基因擴增技術,主要包括變性、退火和延伸三個步驟。這被廣泛用於診斷和分子鑑定。一致的PCR和Pan-PCR技術是基於每種PCR類型使用的引物靶點。

目錄

1. 概述和主要區別
2. 什麼是共識PCR
3. 什麼是Pan-PCR
4. 一致PCR與Pan-PCR的相似性
5. 並排比較-以表格形式進行共識PCR和Pan PCR
6. 摘要

什麼是一致性pcr(c***ensus pcr)?

一致PCR是一種針對特定物種或屬的保守區的PCR技術。因此,選擇高保守區域進行放大。通過這種方法,可以根據生物的一致性進行識別和鑑別。該方法識別特定物種的保守區域。例如,細菌16srrna區域仍然是細菌間的一個保守區。因此,放大隻需一套底漆。在大多數情況下,可為守恆區域使用通用底漆專用。

一致性pcr(c***ensus pcr)和泛聚合酶鏈反應(pan pcr)的區別

圖01:PCR技術

通過採用一致的PCR方法,可以推斷物種特徵和進化關係。根據特定樣本生物體的擴增效率,還可以推斷出該生物體對群體的一致性。此外,進行一致的PCR在系統發育研究中是至關重要的。它允許識別一個物種,並解釋特定有機體在共同祖先方面的偏差。

什麼是泛聚合酶鏈反應(pan pcr)?

Pan-PCR是PCR的一種復接模式。在這項技術中,使用不同的引物靶標擴增不同的菌株。然而,靶點可以是應變群的共同靶點。因此,在Pan-PCR中,一次可以使用兩個以上的引物組。它可以發生在單管反應法或多管反應法中。與常規PCR相比,Pan-PCR更耗時、更復雜。因此,在Pan-PCR中,對PCR結果的解釋也可能更加複雜。

Pan-PCR主要應用於分子診斷。它能通過靶向擴增來區分一個物種的不同菌株。Pan-PCR是一種理想的技術,可以用來鑑定引起疾病的單一物種的不同菌株。在大多數情況下,Pan-PCR技術在各種健康狀況下的自動化非常重要,是一種可靠和高效的技術。

一致性pcr(c***ensus pcr)和泛聚合酶鏈反應(pan pcr)的共同點

  • 共有PCR和Pan-PCR是兩種PCR技術。
  • 這兩種方法都遵循一般的三步程序-變性、退火和拉伸。
  • 它們使用靶向特**引物。
  • 兩種反應都在熱循環器中進行。
  • 這些反應可以自動化。
  • 這兩種方法都可以用於分子診斷和鑑定,但其準確性各不相同。
  • 這些程序需要驗證。

一致性pcr(c***ensus pcr)和泛聚合酶鏈反應(pan pcr)的區別

共識和Pan-PCR都遵循相同的常規程序。然而,一致性PCR和Pan-PCR之間的關鍵區別是基於每個程序使用的引物靶點。而一致性PCR總是以保守區為靶點,而Pan-PCR則以可變區為靶點,以識別一組不同的菌株。由於這種差異,底漆的設計方案、使用的底漆數量和具體應用也各不相同。

下面的信息圖總結了一致性PCR和Pan PCR之間的區別。

一致性pcr(c***ensus pcr)和泛聚合酶鏈反應(pan pcr)的區別

總結 - 一致性pcr(c***ensus pcr) vs. 泛聚合酶鏈反應(pan pcr)

Mulli提出的PCR技術在分子生物學應用中具有重要的革命性作用。共有PCR和Pan-PCR是基於引物靶區的兩種PCR方法。而一致PCR以保守區為靶點,而Pan-PCR則以可變區為靶點,在菌種鑑定中起著重要作用。由於共有PCR和Pan-PCR的基本區別,每一種PCR的具體功能也各不相同,從系統發育分析到分子鑑定再到分子診斷。

引用

1Merkelbach Bruse,S等。“宮頸標本中人**狀瘤病毒檢測和分型的共有聚合酶鏈反應和酶聯免疫吸附試驗”,診斷分子病理學:美國外科病理學雜誌,B部分,美國國家醫學圖書館,1999年3月,
2Yang,Joy Y等。“Pan PCR,基於全基因組序列數據設計細菌分型分析的計算方法”,《臨床微生物學雜誌》,美國微生物學學會,2013年3月,

  • 發表於 2020-09-24 13:16
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