一致性pcr(consensus pcr)和泛聚合酶链反应(pan pcr)的区别

一致PCR与pan PCR的关键区别在于,一致PCR总是以保护区为目标,而pan PCR则以可变区域为目标,以确定一组不同菌株...

一致PCR与pan PCR的关键区别在于,一致PCR总是以保护区为目标,而pan PCR则以可变区域为目标,以确定一组不同菌株

聚合酶链反应(PCR)是一种基因扩增技术,主要包括变性、退火和延伸三个步骤。这被广泛用于诊断和分子鉴定。一致的PCR和Pan-PCR技术是基于每种PCR类型使用的引物靶点。

目录

1. 概述和主要区别
2. 什么是共识PCR
3. 什么是Pan-PCR
4. 一致PCR与Pan-PCR的相似性
5. 并排比较-以表格形式进行共识PCR和Pan PCR
6. 摘要

什么是一致性pcr(c***ensus pcr)?

一致PCR是一种针对特定物种或属的保守区的PCR技术。因此,选择高保守区域进行放大。通过这种方法,可以根据生物的一致性进行识别和鉴别。该方法识别特定物种的保守区域。例如,细菌16srrna区域仍然是细菌间的一个保守区。因此,放大只需一套底漆。在大多数情况下,可为守恒区域使用通用底漆专用。

一致性pcr(c***ensus pcr)和泛聚合酶链反应(pan pcr)的区别

图01:PCR技术

通过采用一致的PCR方法,可以推断物种特征和进化关系。根据特定样本生物体的扩增效率,还可以推断出该生物体对群体的一致性。此外,进行一致的PCR在系统发育研究中是至关重要的。它允许识别一个物种,并解释特定有机体在共同祖先方面的偏差。

什么是泛聚合酶链反应(pan pcr)?

Pan-PCR是PCR的一种复接模式。在这项技术中,使用不同的引物靶标扩增不同的菌株。然而,靶点可以是应变群的共同靶点。因此,在Pan-PCR中,一次可以使用两个以上的引物组。它可以发生在单管反应法或多管反应法中。与常规PCR相比,Pan-PCR更耗时、更复杂。因此,在Pan-PCR中,对PCR结果的解释也可能更加复杂。

Pan-PCR主要应用于分子诊断。它能通过靶向扩增来区分一个物种的不同菌株。Pan-PCR是一种理想的技术,可以用来鉴定引起疾病的单一物种的不同菌株。在大多数情况下,Pan-PCR技术在各种健康状况下的自动化非常重要,是一种可靠和高效的技术。

一致性pcr(c***ensus pcr)和泛聚合酶链反应(pan pcr)的共同点

  • 共有PCR和Pan-PCR是两种PCR技术。
  • 这两种方法都遵循一般的三步程序-变性、退火和拉伸。
  • 它们使用靶向特**引物。
  • 两种反应都在热循环器中进行。
  • 这些反应可以自动化。
  • 这两种方法都可以用于分子诊断和鉴定,但其准确性各不相同。
  • 这些程序需要验证。

一致性pcr(c***ensus pcr)和泛聚合酶链反应(pan pcr)的区别

共识和Pan-PCR都遵循相同的常规程序。然而,一致性PCR和Pan-PCR之间的关键区别是基于每个程序使用的引物靶点。而一致性PCR总是以保守区为靶点,而Pan-PCR则以可变区为靶点,以识别一组不同的菌株。由于这种差异,底漆的设计方案、使用的底漆数量和具体应用也各不相同。

下面的信息图总结了一致性PCR和Pan PCR之间的区别。

一致性pcr(c***ensus pcr)和泛聚合酶链反应(pan pcr)的区别

总结 - 一致性pcr(c***ensus pcr) vs. 泛聚合酶链反应(pan pcr)

Mulli提出的PCR技术在分子生物学应用中具有重要的革命性作用。共有PCR和Pan-PCR是基于引物靶区的两种PCR方法。而一致PCR以保守区为靶点,而Pan-PCR则以可变区为靶点,在菌种鉴定中起着重要作用。由于共有PCR和Pan-PCR的基本区别,每一种PCR的具体功能也各不相同,从系统发育分析到分子鉴定再到分子诊断。

引用

1Merkelbach Bruse,S等。“宫颈标本中人**状瘤病毒检测和分型的共有聚合酶链反应和酶联免疫吸附试验”,诊断分子病理学:美国外科病理学杂志,B部分,美国国家医学图书馆,1999年3月,
2Yang,Joy Y等。“Pan PCR,基于全基因组序列数据设计细菌分型分析的计算方法”,《临床微生物学杂志》,美国微生物学学会,2013年3月,

  • 发表于 2020-09-24 13:16
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  • 分类:科学

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