双链嵌合荧光染色(sybr green)和水解探针(taqman)的区别
sybrgreen和Taqman是检测或观察实时PCR扩增过程的两种方法。SYBR-Green是一种基于**核酸染色染料的方法,Taqman是基于水解探针的方法。这两种技术都是为了在PCR过程中产生荧光而设计的,这使得实时PCR机器能够“实时”监控反应。SYBR-Green法是使用一种叫做SYBR-Green的荧光染料,通过将染料与产生的双链DNA结合来检测扩增。Taqman使用双标记探针进行,通过Taq聚合酶降解探针和荧光团释放来检测扩增。这就是SYBR Green和Taqman之间的关键区别。
内容1。概述和主要区别2。什么是SYBR Green3。什么是Taqman4。并列比较——SYBR Green vs Taqman5。摘要
什么是双链嵌合荧光染色(sybr green)?
SYBR绿是一种荧光染料,在分子生物学中用来染色核酸,特别是双链DNA。采用SYBR-Green法对实时PCR过程中的PCR产物进行定量分析。一旦与DNA结合,产生的DNA染料复合物吸收蓝光并发出强烈的绿光。这是由于染料分子与双链DNA结合时发生的结构变化引起的。当PCR产生越来越多的DNA时,更多的染料分子与DNA结合,产生更多的荧光。因此,荧光强度随着PCR产物的积累而增加。因此,可以用SYBR绿色荧光检测法定量检测PCR产物的含量。
SYBR绿色染料也可用于细胞术和荧光显微镜中的DNA标记。溴化乙锭是一种致癌染料,在凝胶电泳显示DNA时存在处理问题,已成功地用SYBR绿取代了溴化乙锭。
SYBR-green法各有优缺点。该方法灵敏度高,成本低,使用方便。然而,由于它能与任何双链DNA结合,非特**结合会导致PCR产物的过度定量。
什么是水解探针(taqman)?
Taqman是一种替代SYBR-Green的实时PCR检测方法。这种方法依赖于Taq聚合酶5'-3'核酸外切酶活性,在新链延伸和荧光团释放过程中降解探针。该方法以探针水解为基础,采用双标记探针。探针是荧光标记的DNA寡核苷酸,5'端有一个荧光报告分子(荧光团),3'端有一个猝灭分子。它们被设计成与底漆退火相反一侧的单股模板结合。Taq聚合酶向引物中加入核苷酸,并向双标记探针延伸新链。一旦Taq聚合酶遇到探针,Taq聚合酶的核酸外切酶作用激活并降解探针。一旦完成了新链的合成,探针就会完全降解并释放荧光团。荧光团的释放产生荧光。荧光猝灭分子有效地熄灭发射的光,并产生用于定量PCR产物的输出。荧光团的释放与PCR产物的数量成正比。因此,可以通过Taqman方法轻松地进行量化。
Taqman方法用于实时PCR、基因表达定量、遗传多态性检测、染色体DNA缺失定量、细菌鉴定、微阵列分析验证、SNP基因分型等。
双链嵌合荧光染色(sybr green)和水解探针(taqman)的区别
赛博绿vs塔克曼 | |
SYBR绿是基于DNA结合染料。 | Taqman依赖于杂交探针和Taq聚合酶的5′至3′核酸外切酶活性。 |
荧光标记探针 | |
不需要荧光标记探针。 | 需要双标记探头。 |
多重基因分析 | |
它不能用于多重基因靶点。 | 它可以用于多重基因靶点。 |
成本 | |
这个比较便宜。 | 这个比较贵。 |
特** | |
它的特**较低,可与任何双链DNA结合 | 由于探针能检测到特定的扩增产物,因此它们具有高度的特**。 |
有效性 | |
这是不太有效的。 | 这是非常有效的。 |
应用 | |
用于实时PCR、琼脂糖凝胶可视化、DNA标记等。 | 这被用于实时PCR、基因表达定量、基因多态性检测等。 |
总结 - 双链嵌合荧光染色(sybr green) vs. 水解探针(taqman)
Taqman和SYBR-green是实时定量PCR的两种方法。这两种方法都能有效地定量PCR产物并依赖于荧光发射。Taqman方法使用双标记探针检测累积的DNA,而SYBR-Green方法使用荧光染料。这两种方法在分子生物学中也有不同的应用。
参考文献:1。塔贾迪尼、****·哈桑、莫吉塔巴·潘杰普尔和沙加耶·哈希乔伊·贾凡马尔。“四种腺苷受体亚型的实时定量聚合酶链反应分析中SYBR-Green和TaqMan方法的比较”,高级生物医学研究。Mednow Publicati***&Media Pvt Ltd,2014年。网状物。2017年3月13日。“实时PCR基本原理”,实时PCR,定量(qPCR),引物和主成分:Primerdesign Ltd.N.p.,N.d.网站。2017年3月13日。“SYBR绿和其他实时PCR染料。”生物比较。N、 p.,2010年4月5日。网状物。2017年3月14日